Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P16687 Date Thu Jan 5 11:35:34 GMT 2012 Unique Job ID 1d1582f900d402b7

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Y	V	A	V	K	G	G	E	K	A	I	D	A	A	H	A	L	Q	E	S	R	R	R	G	D	T	D	L	P	E	L	S	V	A	Q	I	E	Q	Q	L	N	L	A	V	D	R	V	M	T	E	G	G	I	A	D	R	E	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?					?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	L	A	L	K	Q	A	S	G	D	N	V	E	A	I	F	L	L	R	A	Y	R	T	T	L	A	K	L	A	V	S	E	P	L	D	T	T	G	M	R	L	E	R	R	I	S	A	V	Y	K	D	I	P	G	G	Q	L	L	G	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																						?		?	?	?			?	?	?	?		?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	Y	D	Y	T	H	R	L	L	D	F	T	L	L	A	N	G	E	A	P	T	L	T	T	A	D	S	E	Q	Q	P	S	P	H	V	F	S	L	L	A	R	Q	G	L	A	K	F	E	E	D	S	G	A	Q	P	D	D	I	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	P	P	V	Y	P	C	S	R	S	S	R	L	Q	Q	L	M	R	G	D	E	G	Y	L	L	A	L	A	Y	S	T	Q	R	G	Y	G	R	N	H	P	F	A	G	E	I	R	S	G	Y	I	D	V	S	I	V	P	E	E	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?												?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		F	A	V	N	V	G	E	L	L	M	T	E	C	E	M	V	N	G	F	I	D	P	P	G	E	P	P	H	F	T	R	G	Y	G	L	V	F	G	M	S	E	R	K	A	M	A	M	A	L	V	D	R	A	L	Q	A	P	E	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																												?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.
Sequence		E	H	A	T	G	P	A	Q	D	E	E	F	V	L	A	H	A	D	N	V	E	A	A	G	F	V	S	H	L	K	L	P	H	Y	V	D	F	Q	A	E	L	E	L	L	K	R	L	Q	Q	E	Q	N	H	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand