Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77318 Date Thu Jan 5 12:27:41 GMT 2012 Unique Job ID 1ce50719fc06e2c5

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	S	A	L	K	K	S	V	V	S	T	S	I	S	L	I	L	A	S	G	M	A	A	F	A	A	H	A	A	D	D	V	K	L	K	A	T	K	T	N	V	A	F	S	D	F	T	P	T	E	Y	S	T	K	G	K	P	N	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	V	L	T	M	D	D	L	G	Y	G	Q	L	P	F	D	K	G	S	F	D	P	K	T	M	E	N	R	E	V	V	D	T	Y	K	I	G	I	D	K	A	I	E	A	A	Q	K	S	T	P	T	L	L	S	L	M	D	E	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	F	T	N	G	Y	V	A	H	G	V	S	G	P	S	R	A	A	I	M	T	G	R	A	P	A	R	F	G	V	Y	S	N	T	D	A	Q	D	G	I	P	L	T	E	T	F	L	P	E	L	F	Q	N	H	G	Y	Y	T	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	G	K	W	H	L	S	K	I	S	N	V	P	V	P	E	D	K	Q	T	R	D	Y	H	D	N	F	T	T	F	S	A	E	E	W	Q	P	Q	N	R	G	F	D	Y	F	M	G	F	H	A	A	G	T	A	Y	Y	N	S	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?																			?		?																	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	F	K	N	R	E	R	V	P	A	K	G	Y	I	S	D	Q	L	T	D	E	A	I	G	V	V	D	R	A	K	T	L	D	Q	P	F	M	L	Y	L	A	Y	N	A	P	H	L	P	N	D	N	P	A	P	D	Q	Y	Q	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	N	T	G	S	Q	T	A	D	N	Y	Y	A	S	V	Y	S	V	D	Q	G	V	K	R	I	L	E	Q	L	K	K	N	G	Q	Y	D	N	T	I	I	L	F	T	S	D	N	G	A	V	I	D	G	P	L	P	L	N	G	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?																																									?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	G	Y	K	S	Q	T	Y	P	G	G	T	H	T	P	M	F	M	W	W	K	G	K	L	Q	P	G	N	Y	D	K	L	I	S	A	M	D	F	Y	P	T	A	L	D	A	A	D	I	S	I	P	K	D	L	K	L	D	G	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	L	P	W	L	Q	D	K	K	Q	G	E	P	H	K	N	L	T	W	I	T	S	Y	S	H	W	F	D	E	E	N	I	P	F	W	D	N	Y	H	K	F	V	R	H	Q	S	D	D	Y	P	H	N	P	N	T	E	D	L	S	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?		?	?										?	?	?	?		?	?	?	?								?	?	?		?	?	?	?	?	?	?						?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		F	S	Y	T	V	R	N	N	D	Y	S	L	V	Y	T	V	E	N	N	Q	L	G	L	Y	K	L	T	D	L	Q	Q	K	D	N	L	A	A	A	N	P	Q	V	V	K	E	M	Q	G	V	V	R	E	F	I	D	S	S	Q	P	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560
Sequence		L	S	E	V	N	Q	E	K	F	N	N	I	K	K	A	L	S	E	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand