Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37648 Date Thu Jan 5 11:56:20 GMT 2012 Unique Job ID 1b2e5a2201840589

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	G	T	K	I	R	L	L	A	G	G	L	L	M	M	A	T	A	G	Y	V	Q	A	D	A	L	Q	P	D	P	A	W	Q	Q	G	T	L	S	N	G	L	Q	W	Q	V	L	T	T	P	Q	R	P	S	D	R	V	E	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	L	V	N	T	G	S	L	A	E	S	T	Q	Q	S	G	Y	S	H	A	I	P	R	I	A	L	T	Q	S	G	G	L	D	A	A	Q	A	R	S	L	W	Q	Q	G	I	D	P	K	R	P	M	P	P	V	I	V	S	Y	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?																				?	?														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	L	F	N	L	S	L	P	N	N	R	N	D	L	L	K	E	A	L	S	Y	L	A	N	A	T	G	K	L	T	I	T	P	E	T	I	N	H	A	L	Q	S	Q	D	M	V	A	T	W	P	A	D	T	K	E	G	W	W	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?																			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		R	L	K	G	S	T	L	L	G	H	D	P	A	D	P	L	K	Q	P	V	E	A	E	K	I	K	D	F	Y	Q	K	W	Y	T	P	D	A	M	T	L	L	V	V	G	N	V	D	A	R	S	V	V	D	Q	I	N	K	T	F	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	L	K	G	K	R	E	T	P	A	P	V	P	T	L	S	P	L	R	A	E	A	V	S	I	M	T	D	A	V	R	Q	D	R	L	S	I	M	W	D	T	P	W	Q	P	I	R	E	S	A	A	L	L	R	Y	W	R	A	D	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	R	E	A	L	F	W	H	V	Q	Q	A	L	S	A	S	N	S	K	D	I	G	L	G	F	D	C	R	V	L	Y	L	R	A	Q	C	A	I	N	I	E	S	P	N	D	K	L	N	S	N	L	N	L	V	A	R	E	L	A	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?									?	?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	R	D	K	G	L	P	E	E	E	F	N	A	L	V	A	Q	K	K	L	E	L	Q	K	L	F	A	A	Y	A	R	A	D	T	D	I	L	M	G	Q	R	M	R	S	L	Q	N	Q	V	V	D	I	A	P	E	Q	Y	Q	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	Q	D	F	L	N	S	L	T	V	E	M	L	N	Q	D	L	R	Q	Q	L	S	N	D	M	A	L	I	L	L	Q	P	K	G	E	P	E	F	N	M	K	A	L	Q	A	V	W	D	Q	I	M	A	P	S	T	A	A	A	T	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		S	V	A	T	D	D	V	H	P	E	V	T	D	I	P	P	A	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand