Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37652 Date Thu Jan 5 11:56:24 GMT 2012 Unique Job ID 1aebc5f4b89062a4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	R	K	L	F	W	I	C	A	V	A	M	G	M	S	A	F	P	S	F	M	T	Q	A	T	P	A	T	Q	P	L	I	N	A	E	P	A	V	A	A	Q	T	E	Q	N	P	Q	V	G	Q	V	M	P	G	V	Q	G	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	P	V	V	A	Q	N	G	P	S	R	D	V	K	L	T	F	A	Q	I	A	P	P	P	G	S	M	V	L	R	G	I	N	P	N	G	S	I	E	F	G	M	R	S	D	E	V	V	T	K	A	M	L	N	L	E	Y	T	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?									?	?	?								?		?		?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	S	L	L	P	V	Q	S	Q	L	K	V	Y	L	N	D	E	L	M	G	V	L	P	V	T	K	E	Q	L	G	K	K	T	L	A	Q	M	P	I	N	P	L	F	I	S	D	F	N	R	V	R	L	E	F	V	G	H	Y	Q	D
Secondary structure
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Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	C	E	K	P	A	S	T	T	L	W	L	D	V	G	R	S	S	G	L	D	L	T	Y	Q	T	L	N	V	K	N	D	L	S	H	F	P	V	P	F	F	D	P	S	D	N	R	T	N	T	L	P	M	V	F	A	G	A	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?														?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	G	L	Q	Q	A	S	A	I	V	A	S	W	F	G	S	R	S	G	W	R	G	Q	N	F	P	V	L	Y	N	Q	L	P	D	R	N	A	I	V	F	A	T	N	D	K	R	P	D	F	L	R	D	H	P	A	V	K	A	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?			?				?		?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	E	M	I	N	H	P	Q	N	P	Y	V	K	L	L	V	V	F	G	R	D	D	K	D	L	L	Q	A	A	K	G	I	A	Q	G	N	I	L	F	R	G	E	S	V	V	V	N	E	V	K	P	L	L	P	R	K	P	Y	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	N	W	V	R	T	D	R	P	V	T	F	G	E	L	K	T	Y	E	E	Q	L	Q	S	S	G	L	E	P	A	A	I	N	V	S	L	N	L	P	P	D	L	Y	L	M	R	S	T	G	I	D	M	D	I	N	Y	R	Y	T	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?				?	?	?	?				?				?	?	?	?	?	?								?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	P	V	K	D	S	S	R	M	D	I	S	L	N	N	Q	F	L	Q	S	F	N	L	S	S	K	Q	E	A	N	R	L	L	L	R	I	P	V	L	Q	G	L	L	D	G	K	T	D	V	S	I	P	A	L	K	L	G	A	T	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?													?					?	?	?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Q	L	R	F	D	F	E	Y	M	N	P	M	P	G	G	S	V	D	N	C	I	T	F	Q	P	V	Q	N	H	V	V	I	G	D	D	S	T	I	D	F	S	K	Y	Y	H	F	I	P	M	P	D	L	R	A	F	A	N	A	G	F
Secondary structure
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Disorder												?		?	?	?	?	?	?					?		?																	?	?	?											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		P	F	S	R	M	A	D	L	S	Q	T	I	T	V	M	P	K	A	P	N	E	A	Q	M	E	T	L	L	N	T	V	G	F	I	G	A	Q	T	G	F	P	A	I	N	L	T	V	T	D	D	G	S	T	I	Q	G	K	D	A	D
Secondary structure
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Disorder																																								?													?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		I	M	I	I	G	G	I	P	D	K	L	K	D	D	K	Q	I	D	L	L	V	Q	A	T	E	S	W	V	K	T	P	M	R	Q	T	P	F	P	G	I	V	P	D	E	S	D	R	A	A	E	T	R	S	T	L	T	S	S	G	A
Secondary structure
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Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		M	A	A	V	I	G	F	Q	S	P	Y	N	D	Q	R	S	V	I	A	L	L	A	D	S	P	R	G	Y	E	M	L	N	D	A	V	N	D	S	G	K	R	A	T	M	F	G	S	V	A	V	I	R	E	S	G	I	N	S	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																						?	?	?	?	?													?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		V	G	D	V	Y	Y	V	G	H	L	P	W	F	E	R	V	W	Y	A	L	A	N	H	P	I	L	L	A	V	L	A	A	I	S	V	I	L	L	A	W	V	L	W	R	L	L	R	I	I	S	R	R	R	L	N	P	D	N	E
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Disorder			?	?	?	?																																														?	?	?	?	?	?	?	?	?
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