Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33602 Date Thu Jan 5 11:52:24 GMT 2012 Unique Job ID 1a98496ff5801fe0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	T	I	H	V	D	G	K	E	Y	E	V	N	G	A	D	N	L	L	E	A	C	L	S	L	G	L	D	I	P	Y	F	C	W	H	P	A	L	G	S	V	G	A	C	R	Q	C	A	V	K	Q	Y	Q	N	A	E	D	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																				?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	R	L	V	M	S	C	M	T	P	A	S	D	G	T	F	I	S	I	D	D	E	E	A	K	Q	F	R	E	S	V	V	E	W	L	M	T	N	H	P	H	D	C	P	V	C	E	E	G	G	N	C	H	L	Q	D	M	T	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	G	H	S	F	R	R	Y	R	F	T	K	R	T	H	R	N	Q	D	L	G	P	F	I	S	H	E	M	N	R	C	I	A	C	Y	R	C	V	R	Y	Y	K	D	Y	A	D	G	T	D	L	G	V	Y	G	A	H	D	N	V	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	G	R	P	E	D	G	T	L	E	S	E	F	S	G	N	L	V	E	I	C	P	T	G	V	F	T	D	K	T	H	S	E	R	Y	N	R	K	W	D	M	Q	F	A	P	S	I	C	Q	Q	C	S	I	G	C	N	I	S	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?		?	?	?	?	?		?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	R	Y	G	E	L	R	R	I	E	N	R	Y	N	G	T	V	N	H	Y	F	L	C	D	R	G	R	F	G	Y	G	Y	V	N	L	K	D	R	P	R	Q	P	V	Q	R	R	G	D	D	F	I	T	L	N	A	E	Q	A	M	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?			?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	A	A	D	I	L	R	Q	S	K	K	V	I	G	I	G	S	P	R	A	S	V	E	S	N	F	A	L	R	E	L	V	G	E	E	N	F	Y	T	G	I	A	H	G	E	Q	E	R	L	Q	L	A	L	K	V	L	R	E	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	Y	T	P	A	L	R	E	I	E	S	Y	D	A	V	L	V	L	G	E	D	V	T	Q	T	G	A	R	V	A	L	A	V	R	Q	A	V	K	G	K	A	R	E	M	A	A	A	Q	K	V	A	D	W	Q	I	A	A	I	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	G	Q	R	A	K	H	P	L	F	V	T	N	V	D	D	T	R	L	D	D	I	A	A	W	T	Y	R	A	P	V	E	D	Q	A	R	L	G	F	A	I	A	H	A	L	D	N	S	A	P	A	V	D	G	I	E	P	E	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	K	I	D	V	I	V	Q	A	L	A	G	A	K	K	P	L	I	I	S	G	T	N	A	G	S	L	E	V	I	Q	A	A	A	N	V	A	K	A	L	K	G	R	G	A	D	V	G	I	T	M	I	A	R	S	V	N	S	M	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		L	G	I	M	G	G	G	S	L	E	E	A	L	T	E	L	E	T	G	R	A	D	A	V	V	V	L	E	N	D	L	H	R	H	A	S	A	I	R	V	N	A	A	L	A	K	A	P	L	V	M	V	V	D	H	Q	R	T	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		M	E	N	A	H	L	V	L	S	A	A	S	F	A	E	S	D	G	T	V	I	N	N	E	G	R	A	Q	R	F	F	Q	V	Y	D	P	A	Y	Y	D	S	K	T	V	M	L	E	S	W	R	W	L	H	S	L	H	S	T	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?		?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		S	R	E	V	D	W	T	Q	L	D	H	V	I	D	A	V	V	A	K	I	P	E	L	A	G	I	K	D	A	A	P	D	A	T	F	R	I	R	G	Q	K	L	A	R	E	P	H	R	Y	S	G	R	T	A	M	R	A	N	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?							?	?	?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		V	H	E	P	R	Q	P	Q	D	I	D	T	M	F	T	F	S	M	E	G	N	N	Q	P	T	A	H	R	S	Q	V	P	F	A	W	A	P	G	W	N	S	P	Q	A	W	N	K	F	Q	D	E	V	G	G	K	L	R	F	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																			?	?	?	?	?	?			?									?	?	?	?		?		?				?		?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		P	G	V	R	L	F	E	T	S	E	N	G	L	D	Y	F	T	S	V	P	A	R	F	Q	P	Q	D	G	K	W	R	I	A	P	Y	Y	H	L	F	G	S	D	E	L	S	Q	R	A	P	V	F	Q	S	R	M	P	Q	P	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?			?																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		K	L	N	P	A	D	A	A	K	L	G	V	N	A	G	T	R	V	S	F	S	Y	D	G	N	T	V	T	L	P	V	E	I	A	E	G	L	T	A	G	Q	V	G	L	P	M	G	M	S	G	I	A	P	V	L	A	G	A	H	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		E	D	L	K	E	A	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?
Disorder confidence