Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ABF1 Date Thu Jan 5 11:15:21 GMT 2012 Unique Job ID 1a61aef27431177b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	T	R	V	A	N	F	C	R	K	V	L	S	R	E	E	S	E	A	E	Q	A	V	A	R	P	Q	V	T	V	I	P	R	E	Q	H	A	I	S	R	K	D	I	S	E	N	A	L	K	V	M	Y	R	L	N	K	A	G	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	A	W	L	V	G	G	G	V	R	D	L	L	L	G	K	K	P	K	D	F	D	V	T	T	N	A	T	P	E	Q	V	R	K	L	F	R	N	C	R	L	V	G	R	R	F	R	L	A	H	V	M	F	G	P	E	I	I	E	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	T	F	R	G	H	H	E	G	N	V	S	D	R	T	T	S	Q	R	G	Q	N	G	M	L	L	R	D	N	I	F	G	S	I	E	E	D	A	Q	R	R	D	F	T	I	N	S	L	Y	Y	S	V	A	D	F	T	V	R	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	G	G	M	K	D	L	K	D	G	V	I	R	L	I	G	N	P	E	T	R	Y	R	E	D	P	V	R	M	L	R	A	V	R	F	A	A	K	L	G	M	R	I	S	P	E	T	A	E	P	I	P	R	L	A	T	L	L	N	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	P	P	A	R	L	F	E	E	S	L	K	L	L	Q	A	G	Y	G	Y	E	T	Y	K	L	L	C	E	Y	H	L	F	Q	P	L	F	P	T	I	T	R	Y	F	T	E	N	G	D	S	P	M	E	R	I	I	E	Q	V	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	T	D	T	R	I	H	N	D	M	R	V	N	P	A	F	L	F	A	A	M	F	W	Y	P	L	L	E	T	A	Q	K	I	A	Q	E	S	G	L	T	Y	H	D	A	F	A	L	A	M	N	D	V	L	D	E	A	C	R	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	I	P	K	R	L	T	T	L	T	R	D	I	W	Q	L	Q	L	R	M	S	R	R	Q	G	K	R	A	W	K	L	L	E	H	P	K	F	R	A	A	Y	D	L	L	A	L	R	A	E	V	E	R	N	A	E	L	Q	R	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.
Sequence		K	W	W	G	E	F	Q	V	S	A	P	P	D	Q	K	G	M	L	N	E	L	D	E	E	P	S	P	R	R	R	T	R	R	P	R	K	R	A	P	R	R	E	G	T	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand