Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q47208 Date Thu Jan 5 12:36:39 GMT 2012 Unique Job ID 19fc8736bea991d9

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	H	A	F	I	K	K	G	C	F	Q	D	S	V	S	L	M	I	I	S	R	K	L	S	E	S	E	N	V	D	D	V	S	V	M	M	G	T	P	A	N	K	A	L	L	D	T	T	G	F	W	H	D	D	F	N	N	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?					?																			?	?	?	?	?							?												?	?	?						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	N	D	I	C	V	A	I	R	S	E	A	A	D	A	G	I	A	Q	A	I	M	Q	Q	L	E	E	A	L	K	Q	L	A	Q	G	S	G	S	S	Q	A	L	T	Q	V	R	R	W	D	S	A	C	Q	K	L	P	D	A	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	L	I	S	V	A	G	E	Y	A	A	E	L	A	N	Q	A	L	D	R	N	L	N	V	M	M	F	S	D	N	V	T	L	E	D	E	I	Q	L	K	T	R	A	R	E	K	G	L	L	V	M	G	P	D	C	G	T	S	M	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	G	T	P	L	A	F	A	N	V	M	P	E	G	N	I	G	V	I	G	A	S	G	T	G	I	Q	E	L	C	S	Q	I	A	L	A	G	E	G	I	T	H	A	I	G	L	G	G	R	D	L	S	R	E	V	G	G	I	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	T	A	L	E	M	L	S	A	D	E	K	S	E	V	L	A	F	V	S	K	P	P	A	E	A	V	R	L	K	I	V	N	A	M	K	A	T	G	K	P	T	V	A	L	F	L	G	Y	T	P	A	V	A	R	D	E	N	V	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		F	A	S	S	L	D	E	A	A	R	L	A	C	L	L	S	R	V	T	A	R	R	N	A	I	A	P	V	S	S	G	F	I	C	G	L	Y	T	G	G	T	L	A	A	E	A	A	G	L	L	A	G	H	L	G	V	E	A	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	H	Q	H	G	M	M	L	D	A	D	S	H	Q	I	I	D	L	G	D	D	F	Y	T	V	G	R	P	H	P	M	I	D	P	T	L	R	N	Q	L	I	A	D	L	G	A	K	P	Q	V	R	V	L	L	L	D	V	V	I	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		F	G	A	T	A	D	P	A	A	S	L	V	S	A	W	Q	K	A	C	A	A	R	L	D	N	Q	P	L	Y	A	I	A	T	V	T	G	T	E	R	D	P	Q	C	R	S	Q	Q	I	A	T	L	E	D	A	G	I	A	V	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	L	P	E	A	T	L	L	A	A	A	L	I	H	P	L	S	P	A	A	Q	Q	H	T	P	S	L	L	E	N	V	A	V	I	N	I	G	L	R	S	F	A	L	E	L	Q	S	A	S	K	P	V	V	H	Y	Q	W	S	P	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.
Sequence		A	G	G	N	K	K	L	A	R	L	L	E	R	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand