Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76551 Date Thu Jan 5 12:24:28 GMT 2012 Unique Job ID 19a89f743c2d7629

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	T	R	Q	L	L	S	V	G	I	D	I	G	T	T	T	T	Q	V	I	F	S	R	L	E	L	V	N	R	A	A	V	S	Q	V	P	R	Y	E	F	I	K	R	E	I	S	W	Q	S	P	V	F	F	T	P	V	D	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?	?		?	?	?			?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	G	L	K	E	A	E	L	K	T	L	I	L	E	Q	Y	H	A	A	G	I	E	P	E	S	V	D	S	G	A	I	I	I	T	G	E	S	A	K	T	R	N	A	R	P	A	V	M	A	L	S	Q	S	L	G	D	F	V	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																?		?				?	?	?										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		S	A	G	P	H	L	E	S	V	I	A	G	H	G	A	G	A	Q	T	L	S	E	Q	R	L	C	R	V	L	N	I	D	I	G	G	G	T	A	N	Y	A	L	F	D	A	G	K	I	S	G	T	A	C	L	N	V	G	G	R	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	E	T	D	S	H	G	R	V	V	Y	A	H	K	P	G	Q	M	I	V	D	E	C	F	G	A	G	T	D	A	R	S	L	T	G	A	Q	L	V	Q	V	T	R	R	M	A	E	L	I	V	E	V	I	D	G	T	L	S	P	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?															?			?	?	?	?	?	?																				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	Q	A	L	M	Q	T	G	L	L	P	A	G	V	T	P	E	I	I	T	L	S	G	G	V	G	E	C	Y	R	H	Q	P	A	D	P	F	C	F	A	D	I	G	P	L	L	A	T	A	L	H	D	H	P	R	L	R	E	M	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?		?	?	?				?																						?													?	?			?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	Q	F	P	A	Q	T	V	R	A	T	V	I	G	A	G	A	H	T	L	S	L	S	G	S	T	I	W	L	E	G	V	Q	L	P	L	R	N	L	P	V	A	I	P	I	D	E	T	D	L	V	G	A	W	Q	Q	A	L	I	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?			?																																							?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	D	L	D	P	K	T	D	A	Y	V	L	A	L	P	A	S	L	P	V	R	Y	A	A	V	L	T	V	I	N	A	L	V	D	F	V	A	R	F	P	N	P	H	P	L	L	V	V	A	G	Q	D	F	G	K	A	L	G	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		L	R	P	Q	L	Q	Q	L	P	L	A	V	I	D	E	V	I	V	R	A	G	D	Y	I	D	I	G	T	P	L	F	G	G	S	V	V	P	V	T	V	K	S	L	A	F	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?											?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand