Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AGI4 Date Thu Jan 5 11:29:15 GMT 2012 Unique Job ID 199b480dcd295667

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	K	S	N	P	S	E	V	K	L	A	V	P	T	S	G	G	F	S	G	L	K	S	L	N	L	Q	V	F	V	M	I	A	A	I	I	A	I	M	L	F	F	T	W	T	T	D	G	A	Y	L	S	A	R	N	V	S	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?																				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	R	Q	T	A	I	T	G	I	L	A	V	G	M	V	F	V	I	I	S	A	E	I	D	L	S	V	G	S	M	M	G	L	L	G	G	V	A	A	I	C	D	V	W	L	G	W	P	L	P	L	T	I	I	V	T	L	V	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	L	G	A	W	N	G	W	W	V	A	Y	R	K	V	P	S	F	I	V	T	L	A	G	M	L	A	F	R	G	I	L	I	G	I	T	N	G	T	T	V	S	P	T	S	A	A	M	S	Q	I	G	Q	S	Y	L	P	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	G	F	I	I	G	A	L	G	L	M	A	F	V	G	W	Q	W	R	G	R	M	R	R	Q	A	L	G	L	Q	S	P	A	S	T	A	V	V	G	R	Q	A	L	T	A	I	I	V	L	G	A	I	W	L	L	N	D	Y	R	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?					?	?			?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	P	T	P	V	L	L	L	T	L	L	L	L	G	G	M	F	M	A	T	R	T	A	F	G	R	R	I	Y	A	I	G	G	N	L	E	A	A	R	L	S	G	I	N	V	E	R	T	K	L	A	V	F	A	I	N	G	L	M	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	I	A	G	L	I	L	S	S	R	L	G	A	G	S	P	S	A	G	N	I	A	E	L	D	A	I	A	A	C	V	I	G	G	T	S	L	A	G	G	V	G	S	V	A	G	A	V	M	G	A	F	I	M	A	S	L	D	N	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.
Sequence		M	S	M	M	D	V	P	T	F	W	Q	Y	I	V	K	G	A	I	L	L	L	A	V	W	M	D	S	A	T	K	R	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand