Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32717 Date Thu Jan 5 11:50:40 GMT 2012 Unique Job ID 187506d7713eff93

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	N	S	R	L	F	R	L	S	R	I	V	I	A	L	T	A	A	S	G	M	M	V	N	T	A	N	A	K	E	E	A	K	A	A	T	Q	Y	T	Q	Q	V	N	Q	N	Y	A	K	S	L	P	F	S	D	R	Q	D	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	A	Q	R	G	F	I	A	P	L	L	D	E	G	I	L	R	D	A	N	G	K	V	Y	Y	R	A	D	D	Y	K	F	D	I	N	A	A	A	P	E	T	V	N	P	S	L	W	R	Q	S	Q	I	N	G	I	S	G	L	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?		?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	T	D	K	M	Y	Q	V	R	G	Q	D	I	S	N	I	T	F	V	E	G	E	K	G	I	I	V	I	D	P	L	V	T	P	P	A	A	K	A	A	L	D	L	Y	F	Q	H	R	P	Q	K	P	I	V	A	V	I	Y	T	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	H	T	D	H	Y	G	G	V	K	G	I	I	S	E	A	D	V	K	S	G	K	V	Q	V	I	A	P	A	G	F	M	D	E	A	I	S	E	N	V	L	A	G	N	I	M	S	R	R	A	L	Y	S	Y	G	L	L	L	P	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	A	Q	G	N	V	G	N	G	L	G	V	T	L	A	T	G	D	P	S	I	I	A	P	T	K	T	I	V	R	T	G	E	K	M	I	I	D	G	L	E	F	D	F	L	M	T	P	G	S	E	A	P	A	E	M	H	F	Y	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	A	L	K	A	L	C	T	A	E	N	A	T	H	T	L	H	N	F	Y	T	L	R	G	A	K	T	R	D	T	S	K	W	T	E	Y	L	N	E	T	L	D	M	W	G	N	D	A	E	V	L	F	M	P	H	T	W	P	V	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	N	K	H	I	N	D	Y	I	G	K	Y	R	D	T	I	K	Y	I	H	D	Q	T	L	H	L	A	N	Q	G	Y	T	M	N	E	I	G	D	M	I	K	L	P	P	A	L	A	N	N	W	A	S	R	G	Y	Y	G	S	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		H	N	A	R	A	V	Y	N	F	Y	L	G	Y	Y	D	G	N	P	A	N	L	H	P	Y	G	Q	V	E	M	G	K	R	Y	V	Q	A	L	G	G	S	A	R	V	I	N	L	A	Q	E	A	N	K	Q	G	D	Y	R	W	S	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	L	L	K	Q	V	I	A	A	N	P	G	D	Q	V	A	K	N	L	Q	A	N	N	F	E	Q	L	G	Y	Q	A	E	S	A	T	W	R	G	F	Y	L	T	G	A	K	E	L	R	E	G	V	H	K	F	S	H	G	T	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		S	P	D	T	I	R	G	M	S	V	E	M	L	F	D	F	M	A	V	R	L	D	S	A	K	A	A	G	K	N	I	S	L	N	F	N	M	S	N	G	D	N	L	N	L	T	L	N	D	S	V	L	N	Y	R	K	T	L	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	A	D	A	S	F	Y	I	S	R	E	D	L	H	A	V	L	T	G	Q	A	K	M	A	D	L	V	K	A	K	K	A	K	I	I	G	N	G	A	K	L	E	E	I	I	A	C	L	D	N	F	D	L	W	V	N	I	V	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?			?							?	?	?																												?	?
Disorder confidence
		.
Sequence		N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand