Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31466 Date Thu Jan 5 11:47:54 GMT 2012 Unique Job ID 1838cd9a37bec695

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	H	Q	H	T	T	Q	T	S	G	Q	G	M	L	E	R	V	F	K	L	R	E	H	G	T	T	A	R	T	E	V	I	A	G	F	T	T	F	L	T	M	V	Y	I	V	F	V	N	P	Q	I	L	G	V	A	G	M	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?		?																														?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	A	V	F	V	T	T	C	L	I	A	A	F	G	S	I	M	M	G	L	F	A	N	L	P	V	A	L	A	P	A	M	G	L	N	A	F	F	A	F	V	V	V	Q	A	M	G	L	P	W	Q	V	G	M	G	A	I	F	W	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?			?	?	?	?	?															?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	I	G	L	L	L	L	T	I	F	R	V	R	Y	W	M	I	A	N	I	P	V	S	L	R	V	G	I	T	S	G	I	G	L	F	I	G	M	M	G	L	K	N	A	G	V	I	V	A	N	P	E	T	L	V	S	I	G	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	S	H	S	V	L	L	G	I	L	G	F	F	I	I	A	I	L	A	S	R	N	I	H	A	A	V	L	V	S	I	V	V	T	T	L	L	G	W	M	L	G	D	V	H	Y	N	G	I	V	S	A	P	P	S	V	M	T	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?		?		?	?	?	?		?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	H	V	D	L	A	G	S	F	N	L	G	L	A	G	V	I	F	S	F	M	L	V	N	L	F	D	S	S	G	T	L	I	G	V	T	D	K	A	G	L	A	D	E	K	G	K	F	P	R	M	K	Q	A	L	Y	V	D	S	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?			?		?																																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		S	S	V	T	G	S	F	I	G	T	S	S	V	T	A	Y	I	E	S	S	S	G	V	S	V	G	G	R	T	G	L	T	A	V	V	V	G	L	L	F	L	L	V	I	F	L	S	P	L	A	G	M	V	P	G	Y	A	A	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?				?	?			?	?					?	?		?																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	L	I	Y	V	G	V	L	M	T	S	S	L	A	R	V	N	W	Q	D	L	T	E	S	V	P	A	F	I	T	A	V	M	M	P	F	S	F	S	I	T	E	G	I	A	L	G	F	I	S	Y	C	V	M	K	I	G	T	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.
Sequence		L	R	D	L	S	P	C	V	I	I	V	A	L	L	F	I	L	K	I	V	F	I	D	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand