Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P32674 Date Thu Jan 5 11:50:01 GMT 2012 Unique Job ID 1779802ba0ed5d29

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	N	R	I	S	R	L	K	T	A	L	F	A	N	T	R	E	I	S	L	E	R	A	L	L	Y	T	A	S	H	R	Q	T	E	G	E	P	V	I	L	R	R	A	K	A	T	A	Y	I	L	E	H	V	E	I	S	I	R	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																		?	?
Disorder confidence
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Sequence		E	E	L	I	A	G	N	R	T	V	K	P	R	A	G	I	M	S	P	E	M	D	P	Y	W	L	L	K	E	L	D	Q	F	P	T	R	P	Q	D	R	F	A	I	S	E	E	D	K	R	I	Y	R	E	E	L	F	P	Y	W	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?		?																				?	?		?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
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Sequence		K	R	S	M	K	D	F	I	N	G	Q	M	T	D	E	V	K	A	A	T	N	T	Q	I	F	S	I	N	Q	T	D	K	G	Q	G	H	I	I	I	D	Y	P	R	L	L	N	H	G	L	G	E	L	V	A	Q	M	Q	Q	H	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?																													?
Disorder confidence
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Sequence		Q	Q	Q	P	E	N	H	F	Y	Q	A	A	L	L	L	L	E	A	S	Q	K	H	I	L	R	Y	A	E	L	A	E	T	M	A	A	N	C	T	D	A	Q	R	R	E	E	L	L	T	I	A	E	I	S	R	H	N	A	Q	H	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	Q	T	F	W	Q	A	C	Q	L	F	W	Y	M	N	I	I	L	Q	Y	E	S	N	A	S	S	L	S	L	G	R	F	D	Q	Y	M	L	P	F	Y	Q	T	S	L	T	Q	G	E	D	A	A	F	L	K	E	L	L	E	S	L
Secondary structure
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Disorder																																															?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		W	V	K	C	N	D	I	V	L	L	R	S	T	S	S	A	R	Y	F	A	G	F	P	T	G	Y	T	A	L	L	G	G	L	T	E	N	G	R	S	A	V	N	V	L	S	F	L	C	L	D	A	Y	Q	S	V	Q	L	P	Q	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?		?			?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		N	L	G	V	R	T	N	A	L	I	D	T	P	F	L	M	K	T	A	E	T	I	R	F	G	T	G	I	P	Q	I	F	N	D	E	V	V	V	P	A	F	L	N	R	G	V	S	L	E	D	A	R	D	Y	S	V	V	G	C	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		E	L	S	I	P	G	R	T	Y	G	L	H	D	I	A	M	F	N	L	L	K	V	M	E	I	C	L	H	E	N	E	G	N	A	A	L	T	Y	E	G	L	L	E	Q	I	R	A	K	I	S	H	Y	I	T	L	M	V	E	G	S
Secondary structure
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Disorder																																				?
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Sequence		N	I	C	D	I	G	H	R	D	W	A	P	V	P	L	L	S	S	F	I	S	D	C	L	E	K	G	R	D	I	T	D	G	G	A	R	Y	N	F	S	G	V	Q	G	I	G	I	A	N	L	S	D	S	L	H	A	L	K	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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Sequence		V	F	E	Q	Q	R	L	S	F	D	E	L	L	S	V	L	K	A	N	F	A	T	P	E	G	E	K	V	R	A	R	L	I	N	R	F	E	K	Y	G	N	D	I	D	E	V	D	N	I	S	A	E	L	L	R	H	Y	C	K	E
Secondary structure
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Sequence		V	E	K	Y	Q	N	P	R	G	G	Y	F	T	P	G	S	Y	T	V	S	A	H	V	P	L	G	S	V	V	G	A	T	P	D	G	R	F	A	G	E	Q	L	A	D	G	G	L	S	P	M	L	G	Q	D	A	Q	G	P	T	A
Secondary structure
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Disorder																																														?			?	?	?	?		?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		V	L	K	S	V	S	K	L	D	N	T	L	L	S	N	G	T	L	L	N	V	K	F	T	P	A	T	L	E	G	E	A	G	L	R	K	L	A	D	F	L	R	A	F	T	Q	L	K	L	Q	H	I	Q	F	N	V	V	N	A	D
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Disorder																														?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.
Sequence		T	L	R	E	A	Q	Q	R	P	Q	D	Y	A	G	L	V	V	R	V	A	G	Y	S	A	F	F	V	E	L	S	K	E	I	Q	D	D	I	I	R	R	T	A	H	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?																																		?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand