Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P30845 Date Thu Jan 5 11:46:29 GMT 2012 Unique Job ID 1728a83ca08272db

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	K	R	L	L	K	R	P	S	L	N	L	L	A	W	L	L	L	A	A	F	Y	I	S	I	C	L	N	I	A	F	F	K	Q	V	L	Q	A	L	P	L	D	S	L	H	N	V	L	V	F	L	S	M	P	V	V	A	F	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?			?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	I	N	I	V	L	T	L	S	S	F	L	W	L	N	R	P	L	A	C	L	F	I	L	V	G	A	A	A	Q	Y	F	I	M	T	Y	G	I	V	I	D	R	S	M	I	A	N	I	I	D	T	T	P	A	E	S	Y	A	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	P	Q	M	L	L	T	L	G	F	S	G	V	L	A	A	L	I	A	C	W	I	K	I	K	P	A	T	S	R	L	R	S	V	L	F	R	G	A	N	I	L	V	S	V	L	L	I	L	L	V	A	A	L	F	Y	K	D	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		S	L	F	R	N	N	K	E	L	V	K	S	L	S	P	S	N	S	I	V	A	S	W	S	W	Y	S	H	Q	R	L	A	N	L	P	L	V	R	I	G	E	D	A	H	R	N	P	L	M	Q	N	E	K	R	K	N	L	T	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		I	V	G	E	T	S	R	A	E	N	F	S	L	N	G	Y	P	R	E	T	N	P	R	L	A	K	D	N	V	V	Y	F	P	N	T	A	S	C	G	T	A	T	A	V	S	V	P	C	M	F	S	D	M	P	R	E	H	Y	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																																																?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		E	L	A	Q	H	Q	E	G	V	L	D	I	I	Q	R	A	G	I	N	V	L	W	N	D	N	D	G	G	C	K	G	A	C	D	R	V	P	H	Q	N	V	T	A	L	N	L	P	D	Q	C	I	N	G	E	C	Y	D	E	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																					?	?	?																		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	H	G	L	E	E	Y	I	N	N	L	Q	G	D	G	V	I	V	L	H	T	I	G	S	H	G	P	T	Y	Y	N	R	Y	P	P	Q	F	R	K	F	T	P	T	C	D	T	N	E	I	Q	T	C	T	K	E	Q	L	V	N	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																															?	?		?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		Y	D	N	T	L	V	Y	V	D	Y	I	V	D	K	A	I	N	L	L	K	E	H	Q	D	K	F	T	T	S	L	V	Y	L	S	D	H	G	E	S	L	G	E	N	G	I	Y	L	H	G	L	P	Y	A	I	A	P	D	S	Q	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?																			?	?	?			?					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Q	V	P	M	L	L	W	L	S	E	D	Y	Q	K	R	Y	Q	V	D	Q	N	C	L	Q	K	Q	A	Q	T	Q	H	Y	S	Q	D	N	L	F	S	T	L	L	G	L	T	G	V	E	T	K	Y	Y	Q	A	A	D	D	I	L	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?		?		?		?	?									?																							?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.
Sequence		T	C	R	R	V	S	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand