Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P67444 Date Thu Jan 5 12:10:37 GMT 2012 Unique Job ID 164ee76df6845934

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	D	I	N	H	A	G	S	D	L	I	F	E	L	E	D	R	P	P	F	H	Q	A	L	V	G	A	I	T	H	L	L	A	I	F	V	P	M	V	T	P	A	L	I	V	G	A	A	L	Q	L	S	A	E	T	T	A	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																																		?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	S	M	A	M	I	A	S	G	I	G	T	W	L	Q	V	N	R	Y	G	I	V	G	S	G	L	L	S	I	Q	S	V	N	F	S	F	V	T	V	M	I	A	L	G	S	S	M	K	S	D	G	F	H	E	E	L	I	M	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?								?	?																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	G	V	S	F	V	G	A	F	L	V	V	G	S	S	F	I	L	P	Y	L	R	R	V	I	T	P	T	V	S	G	I	V	V	L	M	I	G	L	S	L	I	K	V	G	I	I	D	F	G	G	G	F	A	A	K	S	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																										?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	F	G	N	Y	E	H	L	G	V	G	L	L	V	L	I	V	V	I	G	F	N	C	C	R	S	P	L	L	R	M	G	G	I	A	I	G	L	C	V	G	Y	I	A	S	L	C	L	G	M	V	D	F	S	S	M	R	N	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?																						?		?	?	?	?	?	?	?																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	I	T	I	P	H	P	F	K	Y	G	F	S	F	S	F	H	Q	F	L	V	V	G	T	I	Y	L	L	S	V	L	E	A	V	G	D	I	T	A	T	A	M	V	S	R	R	P	I	Q	G	E	E	Y	Q	S	R	L	K	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?																																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	L	A	D	G	L	V	S	V	I	A	S	A	V	G	S	L	P	L	T	T	F	A	Q	N	N	G	V	I	Q	M	T	G	V	A	S	R	Y	V	G	R	T	I	A	V	M	L	V	I	L	G	L	F	P	M	I	G	G	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?										?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	T	I	P	S	A	V	L	G	G	A	M	T	L	M	F	S	M	I	A	I	A	G	I	R	I	I	I	T	N	G	L	K	R	R	E	T	L	I	V	A	T	S	L	G	L	G	L	G	V	S	Y	D	P	E	I	F	K	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	A	S	I	Y	V	L	V	E	N	P	I	C	A	G	G	L	T	A	I	L	L	N	I	I	L	P	G	G	Y	R	Q	E	N	V	L	P	G	I	T	S	A	E	E	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?																		?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand