Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P52127 Date Thu Jan 5 12:05:31 GMT 2012 Unique Job ID 16360cac2af7ba32

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	S	N	D	S	G	G	V	A	A	K	H	G	F	L	F	Q	D	C	V	A	A	Y	H	V	T	R	M	L	R	D	K	T	I	R	S	V	R	C	E	V	T	D	D	I	D	I	V	S	D	G	Y	I	D	F	V	Q	V	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	T	G	K	T	R	W	N	I	S	D	I	V	Q	N	S	K	G	A	D	K	K	T	I	P	C	S	S	I	L	H	K	S	M	Q	C	E	S	D	L	S	L	G	R	R	Y	S	I	V	T	E	E	K	V	N	K	T	L	E	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?						?	?	?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	T	I	S	P	N	A	R	L	D	K	P	G	R	Q	E	L	I	D	D	L	N	K	R	T	D	N	F	L	T	D	S	G	I	S	V	S	D	W	I	D	A	A	T	W	E	V	F	S	S	L	R	E	L	E	L	L	G	I	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?								?	?					?	?		?		?																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		N	I	R	L	A	S	Q	D	L	H	G	V	I	L	S	S	E	T	V	A	E	D	I	W	C	R	I	L	D	T	V	T	R	K	G	E	H	S	R	R	I	H	S	A	D	D	K	S	Y	L	R	P	D	L	L	E	W	F	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?				?																				?	?	?				?			?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	V	E	D	D	Q	S	R	S	G	R	K	I	Y	V	K	R	D	L	P	H	I	L	T	P	F	R	A	P	M	A	S	V	C	A	K	R	K	G	Q	V	L	H	Q	Q	Y	S	L	K	K	Y	R	Y	K	H	I	A	D	N	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?					?					?	?		?	?	?																			?	?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		C	Q	W	L	D	E	V	F	L	R	P	K	E	M	S	D	I	H	K	L	T	F	I	E	K	R	E	R	L	K	N	S	V	F	K	S	L	H	D	V	S	E	F	L	G	R	V	L	L	H	A	T	I	R	Q	H	H	E	S	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?	?												?	?		?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	I	P	C	M	L	Y	V	E	K	A	G	A	E	K	I	L	E	N	V	H	I	V	R	R	D	P	E	G	D	Q	L	W	I	G	F	S	E	L	V	T	D	I	N	I	A	V	R	L	P	E	I	R	D	Q	L	Y	E	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	D	C	I	D	T	A	R	K	K	I	L	D	I	K	D	D	N	Y	L	L	R	H	D	I	D	E	I	L	D	G	S	Q	P	F	D	A	H	L	D	R	F	T	F	V	L	F	V	G	Y	D	S	N	L	L	T	E	P	E	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?	?	?	?	?													?	?																							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	G	F	E	D	D	L	E	K	E	T	A	V	L	F	E	K	F	A	A	D	L	I	E	D	S	P	F	A	N	L	C	I	H	V	F	I	Y	P	A	P	S	L	E	R	L	T	Q	L	V	D	E	K	V	R	E	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?																																		?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand