Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P12008 Date Thu Jan 5 11:33:05 GMT 2012 Unique Job ID 1570647b1cba0885

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	G	N	T	I	G	Q	L	F	R	V	T	T	F	G	E	S	H	G	L	A	L	G	C	I	V	D	G	V	P	P	G	I	P	L	T	E	A	D	L	Q	H	D	L	D	R	R	R	P	G	T	S	R	Y	T	T	Q	R	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																																									?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	P	D	Q	V	K	I	L	S	G	V	F	E	G	V	T	T	G	T	S	I	G	L	L	I	E	N	T	D	Q	R	S	Q	D	Y	S	A	I	K	D	V	F	R	P	G	H	A	D	Y	T	Y	E	Q	K	Y	G	L	R	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?		?	?		?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	G	G	G	R	S	S	A	R	E	T	A	M	R	V	A	A	G	A	I	A	K	K	Y	L	A	E	K	F	G	I	E	I	R	G	C	L	T	Q	M	G	D	I	P	L	D	I	K	D	W	S	Q	V	E	Q	N	P	F	F	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	D	P	D	K	I	D	A	L	D	E	L	M	R	A	L	K	K	E	G	D	S	I	G	A	K	V	T	V	V	A	S	G	V	P	A	G	L	G	E	P	V	F	D	R	L	D	A	D	I	A	H	A	L	M	S	I	N	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	G	V	E	I	G	D	G	F	D	V	V	A	L	R	G	S	Q	N	R	D	E	I	T	K	D	G	F	Q	S	N	H	A	G	G	I	L	G	G	I	S	S	G	Q	Q	I	I	A	H	M	A	L	K	P	T	S	S	I	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?		?		?	?							?						?			?		?	?																		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	G	R	T	I	N	R	F	G	E	E	V	E	M	I	T	K	G	R	H	D	P	C	V	G	I	R	A	V	P	I	A	E	A	M	L	A	I	V	L	M	D	H	L	L	R	Q	R	A	Q	N	A	D	V	K	T	D	I	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?		?	?	?	?			?	?																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.
Sequence		W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand