Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75828 Date Wed Jan 25 15:21:03 GMT 2012 Unique Job ID 14f199d9e9627906

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	L	E	R	V	E	I	V	G	F	R	G	I	N	R	L	S	L	M	L	E	Q	N	N	V	L	I	G	E	N	A	W	G	K	S	S	L	L	D	A	L	T	L	L	L	S	P	E	S	D	L	Y	H	F	E	R	D	D	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		W	F	P	P	G	D	I	N	G	R	E	H	H	L	H	I	I	L	T	F	R	E	S	L	P	G	R	H	R	V	R	R	Y	R	P	L	E	A	C	W	T	P	C	T	D	G	Y	H	R	I	F	Y	R	L	E	G	E	S	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?																																																	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	G	S	V	M	T	L	R	S	F	L	D	K	D	G	H	P	I	D	V	E	D	I	N	D	Q	A	R	H	L	V	R	L	M	P	V	L	R	L	R	D	A	R	F	M	R	R	I	R	N	G	T	V	P	N	V	P	N	V	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																								?	?																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	T	A	R	Q	L	D	F	L	A	R	E	L	S	S	H	P	Q	N	L	S	D	G	Q	I	R	Q	G	L	S	A	M	V	Q	L	L	E	H	Y	F	S	E	Q	G	A	G	Q	A	R	Y	R	L	M	R	R	R	A	S	N	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?														?			?	?	?	?																					?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	R	S	W	R	Y	L	D	I	I	N	R	M	I	D	R	P	G	G	R	S	Y	R	V	I	L	L	G	L	F	A	T	L	L	Q	A	K	G	T	L	R	L	D	K	D	A	R	P	L	L	L	I	E	D	P	E	T	R	L	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?					?	?		?					?		?	?			?														?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	I	M	L	S	V	A	W	H	L	L	N	L	L	P	L	Q	R	I	A	T	T	N	S	G	E	L	L	S	L	T	P	V	E	H	V	C	R	L	V	R	E	S	S	R	V	A	A	W	R	L	G	P	S	G	L	S	T	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?																								?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		S	R	R	I	S	F	H	I	R	F	N	R	P	S	S	L	F	A	R	C	W	L	L	V	E	G	E	T	E	T	W	V	I	N	E	L	A	R	Q	C	G	H	H	F	D	A	E	G	I	K	V	I	E	F	A	Q	S	G	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		P	L	V	K	F	A	R	R	M	G	I	E	W	H	V	L	V	D	G	D	E	A	G	K	K	Y	A	A	T	V	R	S	L	L	N	N	D	R	E	A	E	R	E	H	L	T	A	L	P	A	L	D	M	E	H	F	M	Y	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		G	F	S	D	V	F	H	R	M	A	Q	I	P	E	N	V	P	M	N	L	R	K	I	I	S	K	A	I	H	R	S	S	K	P	D	L	A	I	E	V	A	M	E	A	G	R	R	G	V	D	S	V	P	T	L	L	K	K	M	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?																?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.
Sequence		S	R	V	L	W	L	A	R	G	R	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand