Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76198 Date Thu Jan 5 12:20:25 GMT 2012 Unique Job ID 13dfd6e42c9d4900

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	Q	N	K	A	F	S	T	P	F	I	L	A	V	L	C	I	Y	F	S	Y	F	L	H	G	I	S	V	I	T	L	A	Q	N	M	S	S	L	A	E	K	F	S	T	D	N	A	G	I	A	Y	L	I	S	G	I	G	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	L	I	S	I	L	F	F	G	V	I	S	D	K	F	G	R	R	A	V	I	L	M	A	V	I	M	Y	L	L	F	F	F	G	I	P	A	C	P	N	L	T	L	A	Y	G	L	A	V	C	V	G	I	A	N	S	A	L	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	G	Y	P	A	L	M	E	C	F	P	K	A	S	G	S	A	V	I	L	V	K	A	M	V	S	F	G	Q	M	F	Y	P	M	L	V	S	Y	M	L	L	N	N	I	W	Y	G	Y	G	L	I	I	P	G	I	L	F	V	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	L	M	L	L	K	S	K	F	P	S	Q	L	V	D	A	S	V	T	N	E	L	P	Q	M	N	S	K	P	L	V	W	L	E	G	V	S	S	V	L	F	G	V	A	A	F	S	T	F	Y	V	I	V	V	W	M	P	K	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	A	F	A	G	M	S	E	A	E	A	L	K	T	I	S	Y	Y	S	M	G	S	L	V	C	V	F	I	F	A	A	L	L	K	K	M	V	R	P	I	W	A	N	V	F	N	S	A	L	A	T	I	T	A	A	I	I	Y	L	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	S	P	L	V	C	N	A	G	A	F	V	I	G	F	S	A	A	G	G	I	L	Q	L	G	V	S	V	M	S	E	F	F	P	K	S	K	A	K	V	T	S	I	Y	M	M	M	G	G	L	A	N	F	V	I	P	L	I	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	L	S	N	I	G	L	Q	Y	I	I	V	L	D	F	T	F	A	L	L	A	L	I	T	A	I	I	V	F	I	R	Y	Y	R	V	F	I	I	P	E	N	D	V	R	F	G	E	R	K	F	C	T	R	L	N	T	I	K	H	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?	?																			?	?
Disorder confidence
		.
Sequence		G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand