Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AEJ0 Date Thu Jan 5 11:23:27 GMT 2012 Unique Job ID 13647ad399094dcb

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	Q	Q	K	P	L	E	G	A	Q	L	V	I	M	T	I	A	L	S	L	A	T	F	M	Q	V	L	D	S	T	I	A	N	V	A	I	P	T	I	A	G	N	L	G	S	S	L	S	Q	G	T	W	V	I	T	S	F	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	N	A	I	S	I	P	L	T	G	W	L	A	K	R	V	G	E	V	K	L	F	L	W	S	T	I	A	F	A	I	A	S	W	A	C	G	V	S	S	S	L	N	M	L	I	F	F	R	V	I	Q	G	I	V	A	G	P	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	L	S	Q	S	L	L	L	N	N	Y	P	P	A	K	R	S	I	A	L	A	L	W	S	M	T	V	I	V	A	P	I	C	G	P	I	L	G	G	Y	I	S	D	N	Y	H	W	G	W	I	F	F	I	N	V	P	I	G	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	V	L	M	T	L	Q	T	L	R	G	R	E	T	R	T	E	R	R	R	I	D	A	V	G	L	A	L	L	V	I	G	I	G	S	L	Q	I	M	L	D	R	G	K	E	L	D	W	F	S	S	Q	E	I	I	I	L	T	V	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	V	V	A	I	C	F	L	I	V	W	E	L	T	D	D	N	P	I	V	D	L	S	L	F	K	S	R	N	F	T	I	G	C	L	C	I	S	L	A	Y	M	L	Y	F	G	A	I	V	L	L	P	Q	L	L	Q	E	V	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Y	T	A	T	W	A	G	L	A	S	A	P	V	G	I	I	P	V	I	L	S	P	I	I	G	R	F	A	H	K	L	D	M	R	R	L	V	T	F	S	F	I	M	Y	A	V	C	F	Y	W	R	A	Y	T	F	E	P	G	M	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	G	A	S	A	W	P	Q	F	I	Q	G	F	A	V	A	C	F	F	M	P	L	T	T	I	T	L	S	G	L	P	P	E	R	L	A	A	A	S	S	L	S	N	F	T	R	T	L	A	G	S	I	G	T	S	I	T	T	T	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?	?	?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		W	T	N	R	E	S	M	H	H	A	Q	L	T	E	S	V	N	P	F	N	P	N	A	Q	A	M	Y	S	Q	L	E	G	L	G	M	T	Q	Q	Q	A	S	G	W	I	A	Q	Q	I	T	N	Q	G	L	I	I	S	A	N	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?	?	?		?	?	?	?	?	?										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.
Sequence		F	W	M	S	A	G	I	F	L	V	L	L	G	L	V	W	F	A	K	P	P	F	G	A	G	G	G	G	G	G	A	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand