Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A6F5 Date Wed Jan 25 15:20:15 GMT 2012 Unique Job ID 12e555a39416fd79

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	A	K	D	V	K	F	G	N	D	A	R	V	K	M	L	R	G	V	N	V	L	A	D	A	V	K	V	T	L	G	P	K	G	R	N	V	V	L	D	K	S	F	G	A	P	T	I	T	K	D	G	V	S	V	A	R	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																																?			?	?	?															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	L	E	D	K	F	E	N	M	G	A	Q	M	V	K	E	V	A	S	K	A	N	D	A	A	G	D	G	T	T	T	A	T	V	L	A	Q	A	I	I	T	E	G	L	K	A	V	A	A	G	M	N	P	M	D	L	K	R	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		D	K	A	V	T	A	A	V	E	E	L	K	A	L	S	V	P	C	S	D	S	K	A	I	A	Q	V	G	T	I	S	A	N	S	D	E	T	V	G	K	L	I	A	E	A	M	D	K	V	G	K	E	G	V	I	T	V	E	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	G	L	Q	D	E	L	D	V	V	E	G	M	Q	F	D	R	G	Y	L	S	P	Y	F	I	N	K	P	E	T	G	A	V	E	L	E	S	P	F	I	L	L	A	D	K	K	I	S	N	I	R	E	M	L	P	V	L	E	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																			?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	K	A	G	K	P	L	L	I	I	A	E	D	V	E	G	E	A	L	A	T	L	V	V	N	T	M	R	G	I	V	K	V	A	A	V	K	A	P	G	F	G	D	R	R	K	A	M	L	Q	D	I	A	T	L	T	G	G	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?		?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		I	S	E	E	I	G	M	E	L	E	K	A	T	L	E	D	L	G	Q	A	K	R	V	V	I	N	K	D	T	T	T	I	I	D	G	V	G	E	E	A	A	I	Q	G	R	V	A	Q	I	R	Q	Q	I	E	E	A	T	S	D	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?																																?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	R	E	K	L	Q	E	R	V	A	K	L	A	G	G	V	A	V	I	K	V	G	A	A	T	E	V	E	M	K	E	K	K	A	R	V	E	D	A	L	H	A	T	R	A	A	V	E	E	G	V	V	A	G	G	G	V	A	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		R	V	A	S	K	L	A	D	L	R	G	Q	N	E	D	Q	N	V	G	I	K	V	A	L	R	A	M	E	A	P	L	R	Q	I	V	L	N	C	G	E	E	P	S	V	V	A	N	T	V	K	G	G	D	G	N	Y	G	Y	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	T	E	E	Y	G	N	M	I	D	M	G	I	L	D	P	T	K	V	T	R	S	A	L	Q	Y	A	A	S	V	A	G	L	M	I	T	T	E	C	M	V	T	D	L	P	K	N	D	A	A	D	L	G	A	A	G	G	M	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		M	G	G	M	G	G	M	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand