Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P60869 Date Thu Jan 5 12:07:13 GMT 2012 Unique Job ID 12a21bd2baa0167c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	I	N	V	A	E	L	L	N	G	N	Y	I	L	L	L	F	V	V	L	A	L	G	L	C	L	G	K	L	R	L	G	S	I	Q	L	G	N	S	I	G	V	L	V	V	S	L	L	L	G	Q	Q	H	F	S	I	N	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	L	N	L	G	F	M	L	F	I	F	C	V	G	V	E	A	G	P	N	F	F	S	I	F	F	R	D	G	K	N	Y	L	M	L	A	L	V	M	V	G	S	A	L	V	I	A	L	G	L	G	K	L	F	G	W	D	I	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	A	G	M	L	A	G	S	M	T	S	T	P	V	L	V	G	A	G	D	T	L	R	H	S	G	M	E	S	R	Q	L	S	L	A	L	D	N	L	S	L	G	Y	A	L	T	Y	L	I	G	L	V	S	L	I	V	G	A	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	P	K	L	Q	H	Q	D	L	Q	T	S	A	Q	Q	I	A	R	E	R	G	L	D	T	D	A	N	R	K	V	Y	L	P	V	I	R	A	Y	R	V	G	P	E	L	V	A	W	T	D	G	K	N	L	R	E	L	G	I	Y	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?			?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	T	G	C	Y	I	E	R	I	R	R	N	G	I	L	A	N	P	D	G	D	A	V	L	Q	M	G	D	E	I	A	L	V	G	Y	P	D	A	H	A	R	L	D	P	S	F	R	N	G	K	E	V	F	D	R	D	L	L	D	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?																												?						?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	I	V	T	E	E	V	V	V	K	N	H	N	A	V	G	K	R	L	A	Q	L	K	L	T	D	H	G	C	F	L	N	R	V	I	R	S	Q	I	E	M	P	I	D	D	N	V	V	L	N	K	G	D	V	L	Q	V	S	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?												?																					?				?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	R	R	V	K	T	I	A	D	R	I	G	F	I	S	I	H	S	Q	V	T	D	L	L	A	F	C	A	F	F	V	I	G	L	M	I	G	M	I	T	F	Q	F	S	T	F	S	F	G	M	G	N	A	A	G	L	L	F	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	M	L	G	F	M	R	A	N	H	P	T	F	G	Y	I	P	Q	G	A	L	S	M	V	K	E	F	G	L	M	V	F	M	A	G	V	G	L	S	A	G	S	G	I	N	N	G	L	G	A	I	G	G	Q	M	L	I	A	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	V	S	L	V	P	V	V	I	C	F	L	F	G	A	Y	V	L	R	M	N	R	A	L	L	F	G	A	M	M	G	A	R	T	C	A	P	A	M	E	I	I	S	D	T	A	R	S	N	I	P	A	L	G	Y	A	G	T	Y	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.
Sequence		I	A	N	V	L	L	T	L	A	G	T	I	I	V	M	V	W	P	G	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand