Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AE74 Date Thu Jan 5 11:22:42 GMT 2012 Unique Job ID 119e847f2bcc5073

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	L	A	K	D	N	I	W	K	L	L	A	P	L	V	V	M	G	V	M	F	L	I	P	V	P	D	G	M	P	P	Q	A	W	H	Y	F	A	V	F	V	A	M	I	V	G	M	I	L	E	P	I	P	A	T	A	I	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		I	A	V	T	I	C	V	I	G	S	N	Y	L	L	F	D	A	K	E	L	A	D	P	A	F	N	A	Q	K	Q	A	L	K	W	G	L	A	G	F	S	S	T	T	V	W	L	V	F	G	A	F	I	F	A	L	G	Y	E	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	L	G	R	R	I	A	L	F	L	V	K	F	M	G	K	R	T	L	T	L	G	Y	A	I	V	I	I	D	I	L	L	A	P	F	T	P	S	N	T	A	R	T	G	G	T	V	F	P	V	I	K	N	L	P	P	L	F	K	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	P	N	D	P	S	A	R	R	I	G	G	Y	L	M	W	M	M	V	I	S	T	S	L	S	S	S	M	F	V	T	G	A	A	P	N	V	L	G	L	E	F	V	S	K	I	A	G	I	Q	I	S	W	L	Q	W	F	L	C	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	P	V	G	V	I	L	L	I	I	A	P	W	L	S	Y	V	L	Y	K	P	E	I	T	H	S	E	E	V	A	T	W	A	G	D	E	L	K	T	M	G	A	L	T	R	R	E	W	T	L	I	G	L	V	L	L	S	L	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?		?	?	?	?	?	?	?											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		W	V	F	G	S	E	V	I	N	A	T	A	V	G	L	L	A	V	S	L	M	L	A	L	H	V	V	P	W	K	D	I	T	R	Y	N	S	A	W	N	T	L	V	N	L	A	T	L	V	V	M	A	N	G	L	T	R	S	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?																	?									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		I	D	W	F	A	G	T	M	S	T	H	L	E	G	F	S	P	N	A	T	V	I	V	L	V	L	V	F	Y	F	A	H	Y	L	F	A	S	L	S	A	H	T	A	T	M	L	P	V	I	L	A	V	G	K	G	I	P	G	V	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		M	E	Q	L	C	I	L	L	V	L	S	I	G	I	M	G	C	L	T	P	Y	A	T	G	P	G	V	I	I	Y	G	C	G	Y	V	K	S	K	D	Y	W	R	L	G	A	I	F	G	V	I	Y	I	S	M	L	L	L	V	G	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	I	L	A	M	W	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?			?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand