Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P10903 Date Thu Jan 5 11:32:22 GMT 2012 Unique Job ID 117a20ccf6c57a76

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	H	S	S	A	P	E	R	A	T	G	A	V	I	T	D	W	R	P	E	D	P	A	F	W	Q	Q	R	G	Q	R	I	A	S	R	N	L	W	I	S	V	P	C	L	L	L	A	F	C	V	W	M	L	F	S	A	V	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?								?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	L	P	K	V	G	F	N	F	T	T	D	Q	L	F	M	L	T	A	L	P	S	V	S	G	A	L	L	R	V	P	Y	S	F	M	V	P	I	F	G	G	R	R	W	T	A	F	S	T	G	I	L	I	I	P	C	V	W	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	A	V	Q	D	T	S	T	P	Y	S	V	F	I	I	I	S	L	L	C	G	F	A	G	A	N	F	A	S	S	M	A	N	I	S	F	F	F	P	K	Q	K	Q	G	G	A	L	G	L	N	G	G	L	G	N	M	G	V	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	Q	L	V	A	P	L	V	V	S	L	S	I	F	A	V	F	G	S	Q	G	V	K	Q	P	D	G	T	E	L	Y	L	A	N	A	S	W	I	W	V	P	F	L	A	I	F	T	I	A	A	W	F	G	M	N	D	L	A	T	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?		?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	A	S	I	K	E	Q	L	P	V	L	K	R	G	H	L	W	I	M	S	L	L	Y	L	A	T	F	G	S	F	I	G	F	S	A	G	F	A	M	L	S	K	T	Q	F	P	D	V	Q	I	L	Q	Y	A	F	F	G	P	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																									?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	A	L	A	R	S	A	G	G	A	L	S	D	R	L	G	G	T	R	V	T	L	V	N	F	I	L	M	A	I	F	S	G	L	L	F	L	T	L	P	T	D	G	Q	G	G	S	F	M	A	F	F	A	V	F	L	A	L	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																								?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		T	A	G	L	G	S	G	S	T	F	Q	M	I	S	V	I	F	R	K	L	T	M	D	R	V	K	A	E	G	G	S	D	E	R	A	M	R	E	A	A	T	D	T	A	A	A	L	G	F	I	S	A	I	G	A	I	G	G	F	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.
Sequence		I	P	K	A	F	G	S	S	L	A	L	T	G	S	P	V	G	A	M	K	V	F	L	I	F	Y	I	A	C	V	V	I	T	W	A	V	Y	G	R	H	S	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand