Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P75763 Date Thu Jan 5 12:13:52 GMT 2012 Unique Job ID 11055a693ff34ec0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	K	K	S	L	W	K	L	I	L	I	L	A	I	P	C	I	I	G	F	M	P	A	P	A	G	L	S	E	L	A	W	V	L	F	G	I	Y	L	A	A	I	V	G	L	V	I	K	P	F	P	E	P	V	V	L	L	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	A	A	S	M	V	V	V	G	N	L	S	D	G	A	F	K	T	T	A	V	L	S	G	Y	S	S	G	T	T	W	L	V	F	S	A	F	T	L	S	A	A	F	V	T	T	G	L	G	K	R	I	A	Y	L	L	I	G	K	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	N	T	T	L	G	L	G	Y	V	T	V	F	L	D	L	V	L	A	P	A	T	P	S	N	T	A	R	A	G	G	I	V	L	P	I	I	N	S	V	A	V	A	L	G	S	E	P	E	K	S	P	R	R	V	G	H	Y	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		M	S	I	Y	M	V	T	K	T	T	S	Y	M	F	F	T	A	M	A	G	N	I	L	A	L	K	M	I	N	D	I	L	H	L	Q	I	S	W	G	G	W	A	L	A	A	G	L	P	G	I	I	M	L	L	V	T	P	L	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	T	M	Y	P	P	E	I	K	K	V	D	N	K	T	I	A	K	A	G	L	A	E	L	G	P	M	K	I	R	E	K	M	L	L	G	V	F	V	L	A	L	L	G	W	I	F	S	K	S	L	G	V	D	E	S	T	V	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?										?	?		?																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	V	M	A	T	M	L	L	L	G	I	V	T	W	E	D	V	V	K	N	K	G	G	W	N	T	L	I	W	Y	G	G	I	I	G	L	S	S	L	L	S	K	V	K	F	F	E	W	L	A	E	V	F	K	N	N	L	A	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?																																					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	H	G	N	V	A	F	F	V	I	I	F	L	S	I	I	V	R	Y	F	F	A	S	G	S	A	Y	I	V	A	M	L	P	V	F	A	M	L	A	N	V	S	G	A	P	L	M	L	T	A	L	A	L	L	F	S	N	S	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																				?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		G	M	V	T	H	Y	G	G	A	A	G	P	V	I	F	G	V	G	Y	N	D	I	K	S	W	W	L	V	G	A	V	L	T	I	L	T	F	L	V	H	I	T	L	G	V	W	W	W	N	M	L	I	G	W	N	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?			?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand