Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76017 Date Thu Jan 5 12:17:29 GMT 2012 Unique Job ID 10122e2f87dec11c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	G	I	K	Q	H	N	G	N	T	K	A	D	R	L	A	E	L	K	I	R	S	P	S	I	Q	L	I	K	F	G	A	I	G	L	N	A	I	I	F	S	P	L	L	I	A	A	D	T	G	S	Q	Y	G	T	N	I	T	I	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	G	D	R	I	T	G	D	T	A	D	P	S	G	N	L	Y	G	V	M	T	P	A	G	N	T	P	G	N	I	N	L	G	N	D	V	T	V	N	V	N	D	A	S	G	Y	A	K	G	I	I	I	Q	G	K	N	S	S	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?									?		?																					?	?						?	?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	N	R	L	T	V	D	V	V	G	Q	T	S	A	I	G	I	N	L	I	G	D	Y	T	H	A	D	L	G	T	G	S	T	I	K	S	N	D	D	G	I	I	I	G	H	S	S	T	L	T	A	T	Q	F	T	I	E	N	S	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?		?					?	?	?	?																?	?	?	?				?	?	?							?			?	?	?		?	?	?	?			?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	I	G	L	T	I	N	D	Y	G	T	S	V	D	L	G	S	G	S	K	I	T	T	D	G	S	T	G	V	Y	I	G	G	L	N	G	N	N	A	N	G	A	A	R	F	T	A	T	D	L	T	I	D	V	Q	G	Y	S	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																	?		?	?														?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?					?		?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		G	I	N	V	Q	K	N	S	V	V	D	L	G	T	N	S	T	I	K	T	N	G	D	N	A	H	G	L	W	S	F	G	Q	V	S	A	N	A	L	T	V	D	V	T	G	A	A	A	N	G	V	E	V	R	G	G	T	T	T	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	A	D	S	H	I	S	S	A	Q	G	G	G	L	V	T	S	G	S	D	A	I	I	N	F	T	G	T	A	A	Q	R	N	S	I	F	S	G	G	S	Y	G	A	S	A	Q	T	A	T	A	V	V	N	M	Q	N	T	D	I	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?				?	?										?	?		?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	D	R	N	G	S	L	A	L	G	L	W	A	L	S	G	G	R	I	T	G	D	S	L	A	I	T	G	A	A	G	A	R	G	I	Y	A	M	T	N	S	Q	I	D	L	T	S	D	L	V	I	D	M	S	T	P	D	Q	M	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																		?			?				?				?					?		?													?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	A	T	Q	H	D	D	G	Y	A	A	S	R	I	N	A	S	G	R	M	L	I	N	G	S	V	L	S	K	G	G	L	I	N	L	D	M	H	P	G	S	V	W	T	G	S	S	L	S	D	N	V	N	G	G	K	L	D	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?		?			?						?		?			?	?	?																									?	?	?	?		?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		M	N	N	S	V	W	N	V	T	S	N	S	N	L	D	T	L	A	L	S	H	S	T	V	D	F	A	S	H	G	S	T	A	G	T	F	A	T	L	N	V	E	N	L	S	G	N	S	T	F	I	M	R	A	D	V	V	G	E	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?				?	?					?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?																							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		N	G	V	N	N	K	G	D	L	L	N	I	S	G	S	S	A	G	N	H	V	L	A	I	R	N	Q	G	S	E	A	T	T	G	N	E	V	L	T	V	V	K	T	T	D	G	A	A	S	F	S	A	S	S	Q	V	E	L	G	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Y	L	Y	D	V	R	K	N	G	T	N	W	E	L	Y	A	S	G	T	V	P	E	P	T	P	N	P	E	P	T	P	A	P	A	Q	P	P	I	V	N	P	D	P	T	P	E	P	A	P	T	P	K	P	T	T	T	A	D	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		G	N	Y	L	N	V	G	Y	L	L	N	Y	V	E	N	R	T	L	M	Q	R	M	G	D	L	R	N	Q	S	K	D	G	N	I	W	L	R	S	Y	G	G	S	L	D	S	F	A	S	G	K	L	S	G	F	D	M	G	Y	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		I	Q	F	G	G	D	K	R	L	S	D	V	M	P	L	Y	V	G	L	Y	I	G	S	T	H	A	S	P	D	Y	S	G	G	D	G	T	A	R	S	D	Y	M	G	M	Y	A	S	Y	M	A	Q	N	G	F	Y	S	D	L	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		K	A	S	R	Q	K	N	S	F	H	V	L	D	S	Q	N	N	G	V	N	A	N	G	T	A	N	G	M	S	I	S	L	E	A	G	Q	R	F	N	L	S	P	T	G	Y	G	F	Y	I	E	P	Q	T	Q	L	T	Y	S	H	Q
Secondary structure
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Disorder													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		N	E	M	T	M	K	A	S	N	G	L	N	I	H	L	N	H	Y	E	S	L	L	G	R	A	S	M	I	L	G	Y	D	I	T	A	G	N	S	Q	L	N	V	Y	V	K	T	G	A	I	R	E	F	S	G	D	T	E	Y	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?		?	?	?	?	?	?						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.
Sequence		N	N	S	R	E	K	Y	S	F	K	G	N	G	W	N	N	G	V	G	V	S	A	Q	Y	N	K	Q	H	T	F	Y	L	E	A	D	Y	T	Q	G	N	L	F	D	Q	K	Q	V	N	G	G	Y	R	F	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?		?	?	?	?	?	?		?																												?	?	?	?	?	?	?	?										?
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