Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P13518 Date Thu Jan 5 11:33:38 GMT 2012 Unique Job ID 0fba59284080d6c1

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	L	T	T	K	F	S	A	F	V	T	L	L	T	G	L	T	I	F	V	T	L	L	G	C	S	L	S	F	Y	N	A	I	Q	Y	K	F	S	H	R	V	Q	A	V	A	T	A	I	D	T	H	L	V	S	N	D	F	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																					?	?	?																?	?	?							?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	R	P	Q	I	T	E	L	M	M	S	A	D	I	V	R	V	D	L	L	H	G	D	K	Q	V	Y	T	L	A	R	N	G	S	Y	R	P	V	G	S	S	D	L	F	R	E	L	S	V	P	L	I	K	H	P	G	M	S	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?		?																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	V	Y	Q	D	P	M	G	N	Y	F	H	S	L	M	T	T	A	P	L	T	G	A	I	G	F	I	I	V	M	L	F	L	A	V	R	W	L	Q	R	Q	L	A	G	Q	E	L	L	E	T	R	A	T	R	I	L	N	G	E	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?					?									?	?																									?		?	?	?	?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	S	N	V	L	G	T	I	Y	E	W	P	P	R	T	S	S	A	L	D	T	L	L	R	E	I	Q	N	A	R	E	Q	H	S	R	L	D	T	L	I	R	S	Y	A	A	Q	D	V	K	T	G	L	N	N	R	L	F	F	D	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	L	A	T	L	L	E	D	Q	E	K	V	G	T	H	G	I	V	M	M	I	R	L	P	D	F	N	M	L	S	D	T	W	G	H	S	Q	V	E	E	Q	F	F	T	L	T	N	L	L	S	T	F	M	M	R	Y	P	G	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	A	R	Y	H	R	S	D	F	A	A	L	L	P	H	R	T	L	K	E	A	E	S	I	A	G	Q	L	I	K	A	V	D	T	L	P	N	N	K	M	L	D	R	D	D	M	I	H	I	G	I	C	A	W	R	S	G	Q	D	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	Q	V	M	E	H	A	E	S	A	T	R	N	A	G	L	Q	G	G	N	S	W	A	I	Y	D	D	S	L	P	E	K	G	R	G	N	V	R	W	R	T	L	I	E	Q	M	L	S	R	G	G	P	R	L	Y	Q	K	P	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	R	E	G	Q	V	H	H	R	E	L	M	C	R	I	F	D	G	N	E	E	V	S	S	A	E	Y	M	P	M	V	L	Q	F	G	L	S	E	E	Y	D	R	L	Q	I	S	R	L	I	P	L	L	R	Y	W	P	E	E	N	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?		?																																?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		A	I	Q	V	T	V	E	S	L	I	R	P	R	F	Q	R	W	L	R	D	T	L	M	Q	C	E	K	S	Q	R	K	R	I	I	I	E	L	A	E	A	D	V	G	Q	H	I	S	R	L	Q	P	V	I	R	L	V	N	A	L	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		V	R	V	A	V	N	Q	A	G	L	T	L	V	S	T	S	W	I	K	E	L	N	V	E	L	L	K	L	H	P	G	L	V	R	N	I	E	K	R	T	E	N	Q	L	L	V	Q	S	L	V	E	A	C	S	G	T	S	T	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.
Sequence		Y	A	T	G	V	R	S	R	S	E	W	Q	T	L	I	Q	R	G	V	T	G	G	Q	G	D	F	F	A	S	S	Q	P	L	D	T	N	V	K	K	Y	S	Q	R	Y	S	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand