Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A9J0 Date Thu Jan 5 11:10:26 GMT 2012 Unique Job ID 0ec622ab09a81cad

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	A	E	L	L	V	N	V	T	P	S	E	T	R	V	A	Y	I	D	G	G	I	L	Q	E	I	H	I	E	R	E	A	R	R	G	I	V	G	N	I	Y	K	G	R	V	S	R	V	L	P	G	M	Q	A	A	F	V	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																														?	?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	L	D	K	A	A	F	L	H	A	S	D	I	M	P	H	T	E	C	V	A	G	E	E	Q	K	Q	F	T	V	R	D	I	S	E	L	V	R	Q	G	Q	D	L	M	V	Q	V	V	K	D	P	L	G	T	K	G	A	R	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?																?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	D	I	T	L	P	S	R	Y	L	V	F	M	P	G	A	S	H	V	G	V	S	Q	R	I	E	S	E	S	E	R	E	R	L	K	K	V	V	A	E	Y	C	D	E	Q	G	G	F	I	I	R	T	A	A	E	G	V	G	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																									?	?	?	?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	L	A	S	D	A	A	Y	L	K	R	V	W	T	K	V	M	E	R	K	K	R	P	Q	T	R	Y	Q	L	Y	G	E	L	A	L	A	Q	R	V	L	R	D	F	A	D	A	E	L	D	R	I	R	V	D	S	R	L	T	Y	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	L	L	E	F	T	S	E	Y	I	P	E	M	T	S	K	L	E	H	Y	T	G	R	Q	P	I	F	D	L	F	D	V	E	N	E	I	Q	R	A	L	E	R	K	V	E	L	K	S	G	G	Y	L	I	I	D	Q	T	E	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	T	V	D	I	N	T	G	A	F	V	G	H	R	N	L	D	D	T	I	F	N	T	N	I	E	A	T	Q	A	I	A	R	Q	L	R	L	R	N	L	G	G	I	I	I	I	D	F	I	D	M	N	N	E	D	H	R	R	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?																																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	H	S	L	E	Q	A	L	S	K	D	R	V	K	T	S	V	N	G	F	S	A	L	G	L	V	E	M	T	R	K	R	T	R	E	S	I	E	H	V	L	C	N	E	C	P	T	C	H	G	R	G	T	V	K	T	V	E	T	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																												?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		C	Y	E	I	M	R	E	I	V	R	V	H	H	A	Y	D	S	D	R	F	L	V	Y	A	S	P	A	V	A	E	A	L	K	G	E	E	S	H	S	L	A	E	V	E	I	F	V	G	K	Q	V	K	V	Q	I	E	P	L	Y	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?																																										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	E	Q	F	D	V	V	M	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?					?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand