Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P08401 Date Thu Jan 5 11:01:29 GMT 2012 Unique Job ID 0e99a62ab29891d4

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	I	G	M	R	L	L	L	G	Y	F	L	L	V	A	V	A	A	W	F	V	L	A	I	F	V	K	E	V	K	P	G	V	R	R	A	T	E	G	T	L	I	D	T	A	T	L	L	A	E	L	A	R	P	D	L	L	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																																					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		D	P	T	H	G	Q	L	A	Q	A	F	N	Q	L	Q	H	R	P	F	R	A	N	I	G	G	I	N	K	V	R	N	E	Y	H	V	Y	M	T	D	A	Q	G	K	V	L	F	D	S	A	N	K	A	V	G	Q	D	Y	S	R	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		N	D	V	W	L	T	L	R	G	Q	Y	G	A	R	S	T	L	Q	N	P	A	D	P	E	S	S	V	M	Y	V	A	A	P	I	M	D	G	S	R	L	I	G	V	L	S	V	G	K	P	N	A	A	M	A	P	V	I	K	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?			?	?				?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	R	R	I	L	W	A	S	A	I	L	L	G	I	A	L	V	I	G	A	G	M	V	W	W	I	N	R	S	I	A	R	L	T	R	Y	A	D	S	V	T	D	N	K	P	V	P	L	P	D	L	G	S	S	E	L	R	K	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?		?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	A	L	E	S	M	R	V	K	L	E	G	K	N	Y	I	E	Q	Y	V	Y	A	L	T	H	E	L	K	S	P	L	A	A	I	R	G	A	A	E	I	L	R	E	G	P	P	P	E	V	V	A	R	F	T	D	N	I	L	T	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		N	A	R	M	Q	A	L	V	E	T	L	L	R	Q	A	R	L	E	N	R	Q	E	V	V	L	T	A	V	D	V	A	A	L	F	R	R	V	S	E	A	R	T	V	Q	L	A	E	K	K	I	T	L	H	V	T	P	T	E	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?	?	?	?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		V	A	A	E	P	A	L	L	E	Q	A	L	G	N	L	L	D	N	A	I	D	F	T	P	E	S	G	C	I	T	L	S	A	E	V	D	Q	E	H	V	T	L	K	V	L	D	T	G	S	G	I	P	D	Y	A	L	S	R	I	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.
Sequence		E	R	F	Y	S	L	P	R	A	N	G	Q	K	S	S	G	L	G	L	A	F	V	S	E	V	A	R	L	F	N	G	E	V	T	L	R	N	V	Q	E	G	G	V	L	A	S	L	R	L	H	R	H	F	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?																																				?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand