Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P13482 Date Thu Jan 5 11:33:37 GMT 2012 Unique Job ID 0dccd0d7c732942e

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	S	P	A	P	S	R	P	Q	K	M	A	L	I	P	A	C	I	F	L	C	F	A	A	L	S	V	Q	A	E	E	T	P	V	T	P	Q	P	P	D	I	L	L	G	P	L	F	N	D	V	Q	N	A	K	L	F	P	D	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	T	F	A	D	A	V	P	N	S	D	P	L	M	I	L	A	D	Y	R	M	Q	Q	N	Q	S	G	F	D	L	R	H	F	V	N	V	N	F	T	L	P	K	E	G	E	K	Y	V	P	P	E	G	Q	S	L	R	E	H	I	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	L	W	P	V	L	T	R	S	T	E	N	T	E	K	W	D	S	L	L	P	L	P	E	P	Y	V	V	P	G	G	R	F	R	E	V	Y	Y	W	D	S	Y	F	T	M	L	G	L	A	E	S	G	H	W	D	K	V	A	D	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	A	N	F	A	H	E	I	D	T	Y	G	H	I	P	N	G	N	R	S	Y	Y	L	S	R	S	Q	P	P	F	F	A	L	M	V	E	L	L	A	Q	H	E	G	D	A	A	L	K	Q	Y	L	P	Q	M	Q	K	E	Y	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		W	M	D	G	V	E	N	L	Q	A	G	Q	Q	E	K	R	V	V	K	L	Q	D	G	T	L	L	N	R	Y	W	D	D	R	D	T	P	R	P	E	S	W	V	E	D	I	A	T	A	K	S	N	P	N	R	P	A	T	E	I	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	D	L	R	S	A	A	A	S	G	W	D	F	S	S	R	W	M	D	N	P	Q	Q	L	N	T	L	R	T	T	S	I	V	P	V	D	L	N	S	L	M	F	K	M	E	K	I	L	A	R	A	S	K	A	A	G	D	N	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	N	Q	Y	E	T	L	A	N	A	R	Q	K	G	I	E	K	Y	L	W	N	D	Q	Q	G	W	Y	A	D	Y	D	L	K	S	H	K	V	R	N	Q	L	T	A	A	A	L	F	P	L	Y	V	N	A	A	A	K	D	R	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	M	A	T	A	T	K	T	H	L	L	Q	P	G	G	L	N	T	T	S	V	K	S	G	Q	Q	W	D	A	P	N	G	W	A	P	L	Q	W	V	A	T	E	G	L	Q	N	Y	G	Q	K	E	V	A	M	D	I	S	W	H	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	T	N	V	Q	H	T	Y	D	R	E	K	K	L	V	E	K	Y	D	V	S	T	T	G	T	G	G	G	G	G	E	Y	P	L	Q	D	G	F	G	W	T	N	G	V	T	L	K	M	L	D	L	I	C	P	K	E	Q	P	C	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?	?	?	?	?	?																												?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.
Sequence		N	V	P	A	T	R	P	T	V	K	S	A	T	T	Q	P	S	T	K	E	A	Q	P	T	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand