Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76235 Date Thu Jan 5 12:21:00 GMT 2012 Unique Job ID 0d475dbb2e2cf157

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	W	F	I	D	R	R	L	N	G	K	N	K	S	M	V	N	R	Q	R	F	L	R	R	Y	K	A	Q	I	K	Q	S	I	S	E	A	I	N	K	R	S	V	T	D	V	D	S	G	E	S	V	S	I	P	T	E	D	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		E	P	M	F	H	Q	G	R	G	G	L	R	H	R	V	H	P	G	N	D	H	F	V	Q	N	D	R	I	E	R	P	Q	G	G	G	G	G	S	G	S	G	Q	G	Q	A	S	Q	D	G	E	G	Q	D	E	F	V	F	Q	I	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	D	E	Y	L	D	L	L	F	E	D	L	A	L	P	N	L	K	Q	N	Q	Q	R	Q	L	T	E	Y	K	T	H	R	A	G	Y	T	A	N	G	V	P	A	N	I	S	V	V	R	S	L	Q	N	S	L	A	R	R	T	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?														?	?																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	A	G	K	R	R	E	L	H	A	L	E	E	N	L	A	I	I	S	N	S	E	P	A	Q	L	L	E	E	E	R	L	R	K	E	I	A	E	L	R	A	K	I	E	R	V	P	F	I	D	T	F	D	L	R	Y	K	N	Y	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?																			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		K	R	P	D	P	S	S	Q	A	V	M	F	C	L	M	D	V	S	G	S	M	D	Q	S	T	K	D	M	A	K	R	F	Y	I	L	L	Y	L	F	L	S	R	T	Y	K	N	V	E	V	V	Y	I	R	H	H	T	Q	A	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	D	E	H	E	F	F	Y	S	Q	E	T	G	G	T	I	V	S	S	A	L	K	L	M	D	E	V	V	K	E	R	Y	N	P	A	Q	W	N	I	Y	A	A	Q	A	S	D	G	D	N	W	A	D	D	S	P	L	C	H	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?		?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	A	K	K	L	L	P	V	V	R	Y	Y	S	Y	I	E	I	T	R	R	A	H	Q	T	L	W	R	E	Y	E	H	L	Q	S	T	F	D	N	F	A	M	Q	H	I	R	D	Q	D	D	I	Y	P	V	F	R	E	L	F	H	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?								?	?													?	?	?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.
Sequence		Q	N	A	T	A	K	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand