Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77596 Date Thu Jan 5 12:30:53 GMT 2012 Unique Job ID 0c7a84c7c3bd8bb1

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	T	I	E	K	I	F	T	P	Q	D	D	A	F	Y	A	V	I	T	H	A	A	G	P	Q	G	A	L	P	L	T	P	Q	M	L	M	E	S	P	S	G	N	L	F	G	M	T	Q	N	A	G	M	G	W	D	A	N	K	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?				?	?												?			?								?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		G	K	E	V	L	I	I	G	T	Q	G	G	I	R	A	G	D	G	R	P	I	A	L	G	Y	H	T	G	H	W	E	I	G	M	Q	M	Q	A	A	A	K	E	I	T	R	N	G	G	I	P	F	A	A	F	V	S	D	P	C	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?		?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	R	S	Q	G	T	H	G	M	F	D	S	L	P	Y	R	N	D	A	A	I	V	F	R	R	L	I	R	S	L	P	T	R	R	A	V	I	G	V	A	T	C	D	K	G	L	P	A	T	M	I	A	L	A	A	M	H	D	L	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		T	I	L	V	P	G	G	A	T	L	P	P	T	V	G	E	D	A	G	K	V	Q	T	I	G	A	R	F	A	N	H	E	L	S	L	Q	E	A	A	E	L	G	C	R	A	C	A	S	P	G	G	G	C	Q	F	L	G	T	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?														?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	S	Q	V	V	A	E	A	L	G	L	A	L	P	H	S	A	L	A	P	S	G	Q	A	V	W	L	E	I	A	R	Q	S	A	R	A	V	S	E	L	D	S	R	G	I	T	T	R	D	I	L	S	D	K	A	I	E	N	A	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	I	H	A	A	F	G	G	S	T	N	L	L	L	H	I	P	A	I	A	H	A	A	G	C	T	I	P	D	V	E	H	W	T	R	I	N	R	K	V	P	R	L	V	S	V	L	P	N	G	P	D	Y	H	P	T	V	R	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		L	A	G	G	V	P	E	V	M	L	H	L	R	D	L	G	L	L	H	L	D	A	M	T	V	T	G	Q	T	V	G	E	N	L	E	W	W	Q	A	S	E	R	R	A	R	F	R	Q	C	L	R	E	Q	D	G	V	E	P	D	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?	?	?	?	?	?	?					?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	I	L	P	P	E	K	A	K	A	K	G	L	T	S	T	V	C	F	P	T	G	N	I	A	P	E	G	S	V	I	K	A	T	A	I	D	P	S	V	V	G	E	D	G	V	Y	H	H	T	G	R	V	R	V	F	V	S	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?		?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		Q	A	I	K	A	I	K	R	E	E	I	V	Q	G	D	I	M	V	V	I	G	G	G	P	S	G	T	G	M	E	E	T	Y	Q	L	T	S	A	L	K	H	I	S	W	G	K	T	V	S	L	I	T	D	A	R	F	S	G	V	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?		?	?																?						?	?	?	?					?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		T	G	A	C	F	G	H	V	S	P	E	A	L	A	G	G	P	I	G	K	L	R	D	N	D	I	I	E	I	A	V	D	R	L	T	L	T	G	S	V	N	F	I	G	T	A	D	N	P	L	T	P	E	E	G	A	R	E	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.
Sequence		R	R	Q	T	H	P	D	L	H	A	H	D	F	L	P	D	D	T	R	L	W	A	A	L	Q	S	V	S	G	G	T	W	K	G	C	I	Y	D	T	D	K	I	I	E	V	I	N	A	G	K	K	A	L	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?									?		?	?	?	?																					?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand