Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P41052 Date Thu Jan 5 12:01:21 GMT 2012 Unique Job ID 0c1e0159fc6554c0

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	K	R	R	Y	V	T	L	L	P	L	F	V	L	L	A	A	C	S	S	K	P	K	P	T	E	T	D	T	T	T	G	T	P	S	G	G	F	L	L	E	P	Q	H	N	V	M	Q	M	G	G	D	F	A	N	N	P	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		Q	Q	F	I	D	K	M	V	N	K	H	G	F	D	R	Q	Q	L	Q	E	I	L	S	Q	A	K	R	L	D	S	V	L	R	L	M	D	N	Q	A	P	T	T	S	V	K	P	P	S	G	P	N	G	A	W	L	R	Y	R	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?															?								?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	I	T	P	D	N	V	Q	N	G	V	V	F	W	N	Q	Y	E	D	A	L	N	R	A	W	Q	V	Y	G	V	P	P	E	I	I	V	G	I	I	G	V	E	T	R	W	G	R	V	M	G	K	T	R	I	L	D	A	L	A	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?																					?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	S	F	N	Y	P	R	R	A	E	Y	F	S	G	E	L	E	T	F	L	L	M	A	R	D	E	Q	D	D	P	L	N	L	K	G	S	F	A	G	A	M	G	Y	G	Q	F	M	P	S	S	Y	K	Q	Y	A	V	D	F	S	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?																						?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		D	G	H	I	N	L	W	D	P	V	D	A	I	G	S	V	A	N	Y	F	K	A	H	G	W	V	K	G	D	Q	V	A	V	M	A	N	G	Q	A	P	G	L	P	N	G	F	K	T	K	Y	S	I	S	Q	L	A	A	A	G	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																										?																?		?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	P	Q	Q	P	L	G	N	H	Q	Q	A	S	L	L	R	L	D	V	G	T	G	Y	Q	Y	W	Y	G	L	P	N	F	Y	T	I	T	R	Y	N	H	S	T	H	Y	A	M	A	V	W	Q	L	G	Q	A	V	A	L	A	R	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder					?	?	?	?	?		?	?																																													?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.
Sequence		Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand