Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P45759 Date Wed Jan 25 15:20:55 GMT 2012 Unique Job ID 0b50ce24a2b43449

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	R	I	H	S	P	Y	P	A	S	W	A	L	A	Q	R	I	G	Y	L	Y	S	E	G	E	I	I	Y	L	A	D	T	P	F	E	R	L	L	D	I	Q	R	Q	V	G	Q	C	Q	T	M	T	S	L	S	Q	A	D	F	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	L	E	A	V	F	H	Q	N	T	G	E	S	Q	Q	I	A	Q	D	I	D	Q	S	V	D	L	L	S	L	S	E	E	M	P	A	N	E	D	L	L	N	E	D	S	A	A	P	V	I	R	L	I	N	A	I	L	S	E	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	E	T	A	S	D	I	H	I	E	T	Y	E	K	T	M	S	I	R	F	R	I	D	G	V	L	R	T	I	L	Q	P	N	K	K	L	A	A	L	L	I	S	R	I	K	V	M	A	R	L	D	I	A	E	K	R	I	P	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	R	I	S	L	R	I	G	R	R	N	I	D	V	R	V	S	T	L	P	S	I	Y	G	E	R	A	V	L	R	L	L	D	K	N	S	L	Q	L	S	L	N	N	L	G	M	T	A	A	D	K	Q	D	L	E	N	L	I	Q	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	H	G	I	I	L	V	T	G	P	T	G	S	G	K	S	T	T	L	Y	A	I	L	S	A	L	N	T	P	G	R	N	I	L	T	V	E	D	P	V	E	Y	E	L	E	G	I	G	Q	T	Q	V	N	T	R	V	D	M	S	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		A	R	G	L	R	A	I	L	R	Q	D	P	D	V	V	M	V	G	E	I	R	D	T	E	T	A	Q	I	A	V	Q	A	S	L	T	G	H	L	V	L	S	T	L	H	T	N	S	A	S	G	A	V	T	R	L	R	D	M	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	S	F	L	L	S	S	S	L	A	G	I	I	A	Q	R	L	V	R	R	L	C	P	Q	C	R	Q	F	T	P	V	S	P	Q	Q	A	Q	M	F	K	Y	H	Q	L	A	V	T	T	I	G	T	P	V	G	C	P	H	C	H	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																?													?	?													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		S	G	Y	Q	G	R	M	A	I	H	E	M	M	V	V	T	P	E	L	R	A	A	I	H	E	N	V	D	E	Q	A	L	E	R	L	V	R	Q	Q	H	K	A	L	I	K	N	G	L	Q	K	V	I	S	G	D	T	S	W	D	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.
Sequence		V	M	R	V	A	S	A	T	L	E	S	E	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand