Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description Q5H777 Date Wed Jan 25 15:21:15 GMT 2012 Unique Job ID 096077890b650219

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	T	N	I	V	E	V	E	N	F	V	Q	Q	S	E	E	R	R	G	S	A	F	T	Q	E	V	K	R	Y	L	E	R	Y	P	N	T	Q	Y	V	D	V	L	L	T	D	L	N	G	C	F	R	G	K	R	I	P	V	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	K	K	L	E	K	G	C	Y	F	P	A	S	V	F	A	M	D	I	L	G	N	V	V	E	E	A	G	L	G	Q	E	M	G	E	P	D	R	T	C	V	P	V	L	G	S	L	T	P	S	A	A	D	P	E	F	I	G	Q	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	L	T	M	V	D	E	D	G	A	P	F	D	V	E	P	R	N	V	L	N	R	L	W	Q	Q	L	R	Q	R	G	L	F	P	V	V	A	V	E	L	E	F	Y	L	L	D	R	Q	R	D	A	E	G	Y	L	Q	P	P	C	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																			?	?	?								?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		P	G	T	D	D	R	N	T	Q	S	Q	V	Y	S	V	D	N	L	N	H	F	A	D	V	L	N	D	I	D	E	L	A	Q	L	Q	L	I	P	A	D	G	A	V	A	E	A	S	P	G	Q	F	E	I	N	L	Y	H	T	D	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	L	E	A	C	D	D	A	L	A	L	K	R	L	V	R	L	M	A	E	K	H	K	M	H	A	T	F	M	A	K	P	Y	E	E	H	A	G	S	G	M	H	I	H	I	S	M	Q	N	N	R	G	E	N	V	L	S	D	A	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																					?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	E	D	S	P	L	L	K	K	M	L	A	G	M	I	D	L	M	P	S	S	M	A	L	L	A	P	N	V	N	S	Y	R	R	F	Q	P	G	M	Y	V	P	T	Q	A	S	W	G	H	N	N	R	T	V	A	L	R	I	P	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		G	D	R	H	N	H	R	V	E	Y	R	V	A	G	A	D	A	N	P	Y	L	V	M	A	A	I	F	A	G	I	L	H	G	L	D	N	E	L	P	L	Q	E	E	V	E	G	N	G	L	E	Q	E	G	L	P	F	P	I	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																										?						?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.
Sequence		S	D	A	L	G	E	F	I	E	N	D	H	L	R	R	Y	L	G	E	R	F	C	H	V	Y	H	A	C	K	N	D	E	L	L	Q	F	E	R	L	I	T	E	T	E	I	E	W	M	L	K	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand