Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76403 Date Thu Jan 5 12:22:42 GMT 2012 Unique Job ID 094c41be0ddcb11b

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	F	K	P	E	L	L	S	P	A	G	T	L	K	N	M	R	Y	A	F	A	Y	G	A	D	A	V	Y	A	G	Q	P	R	Y	S	L	R	V	R	N	N	E	F	N	H	E	N	L	Q	L	G	I	N	E	A	H	A	L	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	F	Y	V	V	V	N	I	A	P	H	N	A	K	L	K	T	F	I	R	D	L	K	P	V	V	E	M	G	P	D	A	L	I	M	S	D	P	G	L	I	M	L	V	R	E	H	F	P	E	M	P	I	H	L	S	V	Q	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		A	V	N	W	A	T	V	K	F	W	Q	Q	M	G	L	T	R	V	I	L	S	R	E	L	S	L	E	E	I	E	E	I	R	N	Q	V	P	D	M	E	I	E	I	F	V	H	G	A	L	C	M	A	Y	S	G	R	C	L	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	Y	I	N	K	R	D	P	N	Q	G	T	C	T	N	A	C	R	W	E	Y	N	V	Q	E	G	K	E	D	D	V	G	N	I	V	H	K	Y	E	P	I	P	V	Q	N	V	E	P	T	L	G	I	G	A	P	T	D	K	V	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?		?																?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?						?				?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		M	I	E	E	A	Q	R	P	G	E	Y	M	T	A	F	E	D	E	H	G	T	Y	I	M	N	S	K	D	L	R	A	I	A	H	V	E	R	L	T	K	M	G	V	H	S	L	K	I	E	G	R	T	K	S	F	Y	Y	C	A	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	A	Q	V	Y	R	K	A	I	D	D	A	A	A	G	K	P	F	D	T	S	L	L	E	T	L	E	G	L	A	H	R	G	Y	T	E	G	F	L	R	R	H	T	H	D	D	Y	Q	N	Y	E	Y	G	Y	S	V	S	D	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	F	V	G	E	F	T	G	E	R	K	G	D	L	A	A	V	A	V	K	N	K	F	S	V	G	D	S	L	E	L	M	T	P	Q	G	N	I	N	F	T	L	E	H	M	E	N	A	K	G	E	A	M	P	I	A	P	G	D	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.
Sequence		Y	T	V	W	L	P	V	P	Q	D	L	E	L	N	Y	A	L	L	M	R	N	F	S	G	E	T	T	R	N	P	H	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder													?								?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand