Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AFS9 Date Thu Jan 5 11:27:10 GMT 2012 Unique Job ID 093949da700465cf

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	Q	Q	I	A	R	S	V	A	L	A	F	N	N	L	P	R	P	H	R	V	M	L	G	S	L	T	V	L	T	L	A	V	A	V	W	R	P	Y	V	Y	H	R	D	A	T	P	I	V	K	T	I	E	L	E	Q	N	E	I	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		S	L	L	P	E	A	S	E	P	I	D	Q	A	A	Q	E	D	E	A	I	P	Q	D	E	L	D	D	K	I	A	G	E	A	G	V	H	E	Y	V	V	S	T	G	D	T	L	S	S	I	L	N	Q	Y	G	I	D	M	G	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		T	Q	L	A	A	A	D	K	E	L	R	N	L	K	I	G	Q	Q	L	S	W	T	L	T	A	D	G	E	L	Q	R	L	T	W	E	V	S	R	R	E	T	R	T	Y	D	R	T	A	A	N	G	F	K	M	T	S	E	M	Q	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?			?			?																											?													?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	E	W	V	N	N	L	L	K	G	T	V	G	G	S	F	V	A	S	A	R	N	A	G	L	T	S	A	E	V	S	A	V	I	K	A	M	Q	W	Q	M	D	F	R	K	L	K	K	G	D	E	F	A	V	L	M	S	R	E	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																				?		?																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	D	G	K	R	E	Q	S	Q	L	L	G	V	R	L	R	S	E	G	K	D	Y	Y	A	I	R	A	E	D	G	K	F	Y	D	R	N	G	T	G	L	A	K	G	F	L	R	F	P	T	A	K	Q	F	R	I	S	S	N	F	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?																						?	?	?	?	?	?	?	?			?	?	?								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		P	R	R	T	N	P	V	T	G	R	V	A	P	H	R	G	V	D	F	A	M	P	Q	G	T	P	V	L	S	V	G	D	G	E	V	V	V	A	K	R	S	G	A	A	G	Y	Y	V	A	I	R	H	G	R	S	Y	T	T	R	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		M	H	L	R	K	I	L	V	K	P	G	Q	K	V	K	R	G	D	R	I	A	L	S	G	N	T	G	R	S	T	G	P	H	L	H	Y	E	V	W	I	N	Q	Q	A	V	N	P	L	T	A	K	L	P	R	T	E	G	L	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?																																								?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440
Sequence		S	D	R	R	E	F	L	A	Q	A	K	E	I	V	P	Q	L	R	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand