Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P38055 Date Thu Jan 5 11:57:55 GMT 2012 Unique Job ID 08477bcb034bcd9c

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	E	Q	Y	D	Q	I	G	A	R	L	D	R	L	P	L	A	R	F	H	Y	R	I	F	G	I	I	S	F	S	L	L	L	T	G	F	L	S	Y	S	G	N	V	V	L	A	K	L	V	S	N	G	W	S	N	N	F	L	N	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?																																														?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	F	T	S	A	L	M	F	G	Y	F	I	G	S	L	T	G	G	F	I	G	D	Y	F	G	R	R	R	A	F	R	I	N	L	L	I	V	G	I	A	A	T	G	A	A	F	V	P	D	M	Y	W	L	I	F	F	R	F	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	T	G	M	G	A	L	I	M	V	G	Y	A	S	F	T	E	F	I	P	A	T	V	R	G	K	W	S	A	R	L	S	F	V	G	N	W	S	P	M	L	S	A	A	I	G	V	V	V	I	A	F	F	S	W	R	I	M	F	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	G	G	I	G	I	L	L	A	W	F	L	S	G	K	Y	F	I	E	S	P	R	W	L	A	G	K	G	Q	I	A	G	A	E	C	Q	L	R	E	V	E	Q	Q	I	E	R	E	K	S	I	R	L	P	P	L	T	S	Y	Q	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																											?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		N	S	K	V	K	V	I	K	G	T	F	W	L	L	F	K	G	E	M	L	R	R	T	L	V	A	I	T	V	L	I	A	M	N	I	S	L	Y	T	I	T	V	W	I	P	T	I	F	V	N	S	G	I	D	V	D	K	S	I	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																									?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		M	T	A	V	I	M	I	G	A	P	V	G	I	F	I	A	A	L	I	I	D	H	F	P	R	R	L	F	G	S	T	L	L	I	I	I	A	V	L	G	Y	I	Y	S	I	Q	T	T	E	W	A	I	L	I	Y	G	L	V	M	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		F	F	L	Y	M	Y	V	C	F	A	S	A	V	Y	I	P	E	L	W	P	T	H	L	R	L	R	G	S	G	F	V	N	A	V	G	R	I	V	A	V	F	T	P	Y	G	V	A	A	L	L	T	H	Y	G	S	I	T	V	F	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.
Sequence		V	L	G	V	M	L	L	L	C	A	L	V	L	S	I	F	G	I	E	T	R	K	V	S	L	E	E	I	S	E	V	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand