Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0A6Y8 Date Thu Jan 5 11:04:15 GMT 2012 Unique Job ID 083c5b901308e030

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	G	K	I	I	G	I	D	L	G	T	T	N	S	C	V	A	I	M	D	G	T	T	P	R	V	L	E	N	A	E	G	D	R	T	T	P	S	I	I	A	Y	T	Q	D	G	E	T	L	V	G	Q	P	A	K	R	Q	A	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	P	Q	N	T	L	F	A	I	K	R	L	I	G	R	R	F	Q	D	E	E	V	Q	R	D	V	S	I	M	P	F	K	I	I	A	A	D	N	G	D	A	W	V	E	V	K	G	Q	K	M	A	P	P	Q	I	S	A	E	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	K	M	K	K	T	A	E	D	Y	L	G	E	P	V	T	E	A	V	I	T	V	P	A	Y	F	N	D	A	Q	R	Q	A	T	K	D	A	G	R	I	A	G	L	E	V	K	R	I	I	N	E	P	T	A	A	A	L	A	Y	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	D	K	G	T	G	N	R	T	I	A	V	Y	D	L	G	G	G	T	F	D	I	S	I	I	E	I	D	E	V	D	G	E	K	T	F	E	V	L	A	T	N	G	D	T	H	L	G	G	E	D	F	D	S	R	L	I	N	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?																											?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		V	E	E	F	K	K	D	Q	G	I	D	L	R	N	D	P	L	A	M	Q	R	L	K	E	A	A	E	K	A	K	I	E	L	S	S	A	Q	Q	T	D	V	N	L	P	Y	I	T	A	D	A	T	G	P	K	H	M	N	I	K	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	R	A	K	L	E	S	L	V	E	D	L	V	N	R	S	I	E	P	L	K	V	A	L	Q	D	A	G	L	S	V	S	D	I	D	D	V	I	L	V	G	G	Q	T	R	M	P	M	V	Q	K	K	V	A	E	F	F	G	K	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		P	R	K	D	V	N	P	D	E	A	V	A	I	G	A	A	V	Q	G	G	V	L	T	G	D	V	K	D	V	L	L	L	D	V	T	P	L	S	L	G	I	E	T	M	G	G	V	M	T	T	L	I	A	K	N	T	T	I	P	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		K	H	S	Q	V	F	S	T	A	E	D	N	Q	S	A	V	T	I	H	V	L	Q	G	E	R	K	R	A	A	D	N	K	S	L	G	Q	F	N	L	D	G	I	N	P	A	P	R	G	M	P	Q	I	E	V	T	F	D	I	D	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																										?	?	?															?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		D	G	I	L	H	V	S	A	K	D	K	N	S	G	K	E	Q	K	I	T	I	K	A	S	S	G	L	N	E	D	E	I	Q	K	M	V	R	D	A	E	A	N	A	E	A	D	R	K	F	E	E	L	V	Q	T	R	N	Q	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?																														?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		H	L	L	H	S	T	R	K	Q	V	E	E	A	G	D	K	L	P	A	D	D	K	T	A	I	E	S	A	L	T	A	L	E	T	A	L	K	G	E	D	K	A	A	I	E	A	K	M	Q	E	L	A	Q	V	S	Q	K	L	M	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?																						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		I	A	Q	Q	Q	H	A	Q	Q	Q	T	A	G	A	D	A	S	A	N	N	A	K	D	D	D	V	V	D	A	E	F	E	E	V	K	D	K	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand