Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P16525 Date Thu Jan 5 11:35:12 GMT 2012 Unique Job ID 07edb23663b05daf

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	A	R	Y	D	L	V	D	R	L	N	T	T	F	R	Q	M	E	Q	E	L	A	I	F	A	A	H	L	E	Q	H	K	L	L	V	A	R	V	F	S	L	P	E	V	K	K	E	D	E	H	N	P	L	N	R	I	E	V	K	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																								?	?	?	?	?	?			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		H	L	G	N	D	A	Q	S	L	A	L	R	H	F	R	H	L	F	I	Q	Q	Q	S	E	N	R	S	S	K	A	A	V	R	L	P	G	V	L	C	Y	Q	V	D	N	L	S	Q	A	A	L	V	S	H	I	Q	H	I	N	K	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																				?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		K	T	T	F	E	H	I	V	T	V	E	S	E	L	P	T	A	A	R	F	E	W	V	H	R	H	L	P	G	L	I	T	L	N	A	Y	R	T	L	T	V	L	H	D	P	A	T	L	R	F	G	W	A	N	K	H	I	I	K	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?	?	?	?	?																																						?	?	?	?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	H	R	D	E	V	L	A	Q	L	E	K	S	L	K	S	P	R	S	V	A	P	W	T	R	E	E	W	Q	R	K	L	E	R	E	Y	Q	D	I	A	A	L	P	Q	N	A	K	L	K	I	K	R	P	V	K	V	Q	P	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		R	V	W	Y	K	G	D	Q	K	Q	V	Q	H	A	C	P	T	P	L	I	A	L	I	N	R	D	N	G	A	G	V	P	D	V	G	E	L	L	N	Y	D	A	D	N	V	Q	H	R	Y	K	P	Q	A	Q	P	L	R	L	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	R	L	H	L	Y	V	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand