Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77504 Date Thu Jan 5 12:30:05 GMT 2012 Unique Job ID 07352cab8308d1f3

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	A	R	W	F	W	R	E	W	R	S	P	S	L	L	I	V	W	L	A	L	S	L	A	V	A	C	V	L	A	L	G	N	I	S	D	R	M	E	K	G	L	S	Q	Q	S	R	E	F	M	A	G	D	R	A	L	R	S	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																																																?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	E	V	P	Q	A	W	L	E	E	A	Q	K	R	G	L	K	V	G	K	Q	L	T	F	A	T	M	T	F	A	G	D	T	P	Q	L	A	N	V	K	A	V	D	D	I	Y	P	M	Y	G	D	L	Q	T	N	P	P	G	L	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?		?	?	?	?	?	?		?	?	?	?			?	?	?	?	?	?	?																			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		P	Q	A	G	S	V	L	L	A	P	R	L	M	A	L	L	N	L	K	T	G	D	T	I	D	V	G	D	A	T	L	R	I	A	G	E	V	I	Q	E	P	D	S	G	F	N	P	F	Q	M	A	P	R	L	M	M	N	L	A	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																																				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	D	K	T	G	A	V	Q	P	G	S	R	V	T	W	R	Y	K	F	G	G	N	E	N	Q	L	D	G	Y	E	K	W	L	L	P	Q	L	K	P	E	Q	R	W	Y	G	L	E	Q	D	E	G	A	L	G	R	S	M	E	R	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																																											?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Q	Q	F	L	L	L	S	A	L	L	T	L	L	L	A	V	A	A	V	A	V	A	M	N	H	Y	C	R	S	R	Y	D	L	V	A	I	L	K	T	L	G	A	G	R	A	Q	L	R	K	L	I	V	G	Q	W	L	M	V	L	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	S	A	V	T	G	G	A	I	G	L	L	F	E	N	V	L	M	V	L	L	K	P	V	L	P	A	A	L	P	P	A	S	L	W	P	W	L	W	A	L	G	T	M	T	V	I	S	L	L	V	G	L	R	P	Y	R	L	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																												?					?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	T	Q	P	L	R	V	L	R	N	D	V	V	A	N	V	W	P	L	K	F	Y	L	P	I	V	S	V	V	V	V	L	L	L	A	G	L	M	G	G	S	M	L	L	W	A	V	L	A	G	A	V	V	L	A	L	L	C	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		L	G	W	M	L	L	N	V	L	R	R	M	T	L	K	S	L	P	L	R	L	A	V	S	R	L	L	R	Q	P	W	S	T	L	S	Q	L	S	A	F	S	L	S	F	M	L	L	A	L	L	L	V	L	R	G	D	L	L	D	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?									?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		W	Q	Q	Q	L	P	P	E	S	P	N	Y	F	L	I	N	I	A	T	E	Q	V	A	P	L	K	A	F	L	A	E	H	Q	I	V	P	E	S	F	Y	P	V	V	R	A	R	L	T	A	I	N	D	K	P	T	E	G	N	E	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?										?		?	?	?	?																	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		E	A	L	N	R	E	L	N	L	T	W	Q	N	T	R	P	D	H	N	P	I	V	A	G	N	W	P	P	K	A	D	E	V	S	M	E	E	G	L	A	K	R	L	N	V	A	L	G	D	T	V	T	F	M	G	D	T	Q	E	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?									?	?		?	?								?			?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		R	A	K	V	T	S	L	R	K	V	D	W	E	S	L	R	P	N	F	Y	F	I	F	P	E	G	A	L	D	G	Q	P	Q	S	W	L	T	S	F	R	W	E	N	G	N	G	M	L	T	Q	L	N	R	Q	F	P	T	I	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		L	D	I	G	A	I	L	K	Q	V	G	Q	V	L	E	Q	V	S	R	A	L	E	V	M	V	V	L	V	T	A	C	G	M	L	L	L	L	A	Q	V	Q	V	G	M	R	Q	R	H	Q	E	L	V	V	W	R	T	L	G	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		K	K	L	L	R	T	T	L	W	C	E	F	A	M	L	G	F	V	S	G	L	V	A	A	I	G	A	E	T	A	L	A	V	L	Q	A	K	V	F	D	F	P	W	E	P	D	W	R	L	W	I	V	L	P	C	S	G	A	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																									?	?				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.
Sequence		L	S	L	F	G	G	W	L	G	A	R	L	V	K	G	K	A	L	F	R	Q	F	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?			?	?	?	?						?	?	?
Disorder confidence