Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P19934 Date Thu Jan 5 11:37:42 GMT 2012 Unique Job ID 06f97779bad92f40

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	K	A	T	E	Q	N	D	K	L	K	R	A	I	I	I	S	A	V	L	H	V	I	L	F	A	A	L	I	W	S	S	F	D	E	N	I	E	A	S	A	G	G	G	G	G	S	S	I	D	A	V	M	V	D	S	G	A	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?						?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		V	E	Q	Y	K	R	M	Q	S	Q	E	S	S	A	K	R	S	D	E	Q	R	K	M	K	E	Q	Q	A	A	E	E	L	R	E	K	Q	A	A	E	Q	E	R	L	K	Q	L	E	K	E	R	L	A	A	Q	E	Q	K	K	Q	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		E	E	A	A	K	Q	A	E	L	K	Q	K	Q	A	E	E	A	A	A	K	A	A	A	D	A	K	A	K	A	E	A	D	A	K	A	A	E	E	A	A	K	K	A	A	A	D	A	K	K	K	A	E	A	E	A	A	K	A	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	A	Q	K	K	A	E	A	A	A	A	A	L	K	K	K	A	E	A	A	E	A	A	A	A	E	A	R	K	K	A	A	T	E	A	A	E	K	A	K	A	E	A	E	K	K	A	A	A	E	K	A	A	A	D	K	K	A	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	K	A	A	A	D	K	K	A	A	E	K	A	A	A	E	K	A	A	A	D	K	K	A	A	A	E	K	A	A	A	D	K	K	A	A	A	A	K	A	A	A	E	K	A	A	A	A	K	A	A	A	E	A	D	D	I	F	G	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																												?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	S	S	G	K	N	A	P	K	T	G	G	G	A	K	G	N	N	A	S	P	A	G	S	G	N	T	K	N	N	G	A	S	G	A	D	I	N	N	Y	A	G	Q	I	K	S	A	I	E	S	K	F	Y	D	A	S	S	Y	A	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																?	?		?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		K	T	C	T	L	R	I	K	L	A	P	D	G	M	L	L	D	I	K	P	E	G	G	D	P	A	L	C	Q	A	A	L	A	A	A	K	L	A	K	I	P	K	P	P	S	Q	A	V	Y	E	V	F	K	N	A	P	L	D	F	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?									?	?		?						?	?	?															?	?	?	?	?	?	?		?										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.
Sequence		P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand