Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P22523 Date Wed Jan 25 15:20:42 GMT 2012 Unique Job ID 067380b0756e9b95

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	I	E	R	G	K	F	R	S	L	T	L	I	N	W	N	G	F	F	A	R	T	F	D	L	D	E	L	V	T	T	L	S	G	G	N	G	A	G	K	S	T	T	M	A	A	F	V	T	A	L	I	P	D	L	T	L	L	H	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?																																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		R	N	T	T	E	A	G	A	T	S	G	S	R	D	K	G	L	H	G	K	L	K	A	G	V	C	Y	S	M	L	D	T	I	N	S	R	H	Q	R	V	V	V	G	V	R	L	Q	Q	V	A	G	R	D	R	K	V	D	I	K	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?		?																												?		?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	A	I	Q	G	L	P	M	S	V	Q	P	T	Q	L	V	T	E	T	L	N	E	R	Q	A	R	V	L	P	L	N	E	L	K	D	K	L	E	A	M	E	G	V	Q	F	K	Q	F	N	S	I	T	D	Y	H	S	L	M	F	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?		?									?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																															?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		L	G	I	I	A	R	R	L	R	S	A	S	D	R	S	K	F	Y	R	L	I	E	A	S	L	Y	G	G	I	S	S	A	I	T	R	S	L	R	D	Y	L	L	P	E	N	S	G	V	R	K	A	F	Q	D	M	E	A	A	L	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?				?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		E	N	R	M	T	L	E	A	I	R	V	T	Q	S	D	R	D	L	F	K	H	L	I	S	E	A	T	N	Y	V	A	A	D	Y	M	R	H	A	N	E	R	R	V	H	L	D	K	A	L	E	F	R	R	E	L	H	T	S	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		Q	L	A	A	E	Q	Y	K	H	V	D	M	A	R	E	L	A	E	H	N	G	A	E	G	D	L	E	A	D	Y	Q	A	A	S	D	H	L	N	L	V	Q	T	A	L	R	Q	Q	E	K	I	E	R	Y	E	A	D	L	D	E	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Q	I	R	L	E	E	Q	N	E	V	V	A	E	A	I	E	R	Q	Q	E	N	E	A	R	A	E	A	A	E	L	E	V	D	E	L	K	S	Q	L	A	D	Y	Q	Q	A	L	D	V	Q	Q	T	R	A	I	Q	Y	N	Q	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	A	L	N	R	A	K	E	L	C	H	L	P	D	L	T	A	D	C	A	A	E	W	L	E	T	F	Q	A	K	E	L	E	A	T	E	K	M	L	S	L	E	Q	K	M	S	M	A	Q	T	A	H	S	Q	F	E	Q	A	Y	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		L	V	V	A	I	N	G	P	L	A	R	N	E	A	W	D	V	A	R	E	L	L	R	E	G	V	D	Q	R	H	L	A	E	Q	V	Q	P	L	R	M	R	L	S	E	L	E	Q	R	L	R	E	Q	Q	E	A	E	R	L	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		D	F	C	K	R	Q	G	K	N	F	D	I	D	E	L	E	A	L	H	Q	E	L	E	A	R	I	A	S	L	S	D	S	V	S	N	A	R	E	E	R	M	A	L	R	Q	E	Q	E	Q	L	Q	S	R	I	Q	S	L	M	Q	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		A	P	V	W	L	A	A	Q	N	S	L	N	Q	L	S	E	Q	C	G	E	E	F	T	S	S	Q	D	V	T	E	Y	L	Q	Q	L	L	E	R	E	R	E	A	I	V	E	R	D	E	V	G	A	R	K	N	A	V	D	E	E	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		E	R	L	S	Q	P	G	G	S	E	D	Q	R	L	N	A	L	A	E	R	F	G	G	V	L	L	S	E	I	Y	D	D	V	S	L	E	D	A	P	Y	F	S	A	L	Y	G	P	S	R	H	A	I	V	V	P	D	L	S	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		T	E	H	L	E	G	L	T	D	C	P	E	D	L	Y	L	I	E	G	D	P	Q	S	F	D	D	S	V	F	S	V	D	E	L	E	K	A	V	V	V	K	I	A	D	R	Q	W	R	Y	S	R	F	P	E	V	P	L	F	G	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		A	A	R	E	S	R	I	E	S	L	H	A	E	R	E	V	L	S	E	R	F	A	T	L	S	F	D	V	Q	K	T	Q	R	L	H	Q	A	F	S	R	F	I	G	S	H	L	A	V	A	F	E	S	D	P	E	A	E	I	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		L	N	S	R	R	V	E	L	E	R	A	L	S	N	H	E	N	D	N	Q	Q	Q	R	I	Q	F	E	Q	A	K	E	G	V	T	A	L	N	R	I	L	P	R	L	N	L	L	A	D	D	S	L	A	D	R	V	D	E	I	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		R	L	D	E	A	Q	E	A	A	R	F	V	Q	Q	F	G	N	Q	L	A	K	L	E	P	I	V	S	V	L	Q	S	D	P	E	Q	F	E	Q	L	K	E	D	Y	A	Y	S	Q	Q	M	Q	R	D	A	R	Q	Q	A	F	A	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		T	E	V	V	Q	R	R	A	H	F	S	Y	S	D	S	A	E	M	L	S	G	N	S	D	L	N	E	K	L	R	E	R	L	E	Q	A	E	A	E	R	T	R	A	R	E	A	L	R	G	H	A	A	Q	L	S	Q	Y	N	Q	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1030	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1040	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1050	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1060	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1070	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1080
Sequence		L	A	S	L	K	S	S	Y	D	T	K	K	E	L	L	N	D	L	Q	R	E	L	Q	D	I	G	V	R	A	D	S	G	A	E	E	R	A	R	I	R	R	D	E	L	H	A	Q	L	S	N	N	R	S	R	R	N	Q	L	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		A	L	T	F	C	E	A	E	M	D	N	L	T	R	K	L	R	K	L	E	R	D	Y	F	E	M	R	E	Q	V	V	T	A	K	A	G	W	C	A	V	M	R	M	V	K	D	N	G	V	E	R	R	L	H	R	R	E	L	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1180	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1200
Sequence		L	S	A	D	D	L	R	S	M	S	D	K	A	L	G	A	L	R	L	A	V	A	D	N	E	H	L	R	D	V	L	R	M	S	E	D	P	K	R	P	E	R	K	I	Q	F	F	V	A	V	Y	Q	H	L	R	E	R	I	R	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1240	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1260
Sequence		D	I	I	R	T	D	D	P	V	E	A	I	E	Q	M	E	I	E	L	S	R	L	T	E	E	L	T	S	R	E	Q	K	L	A	I	S	S	R	S	V	A	N	I	I	R	K	T	I	Q	R	E	Q	N	R	I	R	M	L	N	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1300	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1320
Sequence		G	L	Q	N	V	S	F	G	Q	V	N	S	V	R	L	N	V	N	V	R	E	T	H	A	M	L	L	D	V	L	S	E	Q	H	E	Q	H	Q	D	L	F	N	S	N	R	L	T	F	S	E	A	L	A	K	L	Y	Q	R	L	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1360	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1380
Sequence		P	Q	I	D	M	G	Q	R	T	P	Q	T	I	G	E	E	L	L	D	Y	R	N	Y	L	E	M	E	V	E	V	N	R	G	S	D	G	W	L	R	A	E	S	G	A	L	S	T	G	E	A	I	G	T	G	M	S	I	L	V	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																				?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1420	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1440
Sequence		V	V	Q	S	W	E	D	E	S	R	R	L	R	G	K	D	I	S	P	C	R	L	L	F	L	D	E	A	A	R	L	D	A	R	S	I	A	T	L	F	E	L	C	E	R	L	Q	M	Q	L	I	I	A	A	P	E	N	I	S	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?	?	?	?	?	?								?				?	?	?		?	?																				?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1480	.	.	.	.	.	.
Sequence		E	K	G	T	T	Y	K	L	V	R	K	V	F	Q	N	T	E	H	V	H	V	V	G	L	R	G	F	A	P	Q	L	P	E	T	L	P	G	T	D	E	A	P	S	Q	A	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?												?																					?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence