Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0AD27 Date Wed Jan 25 15:20:24 GMT 2012 Unique Job ID 0512e077ab4d66ac

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	V	T	H	R	Q	R	Y	R	E	K	V	S	Q	M	V	S	W	G	H	W	F	A	L	F	N	I	L	L	S	L	V	I	G	S	R	Y	L	F	I	A	D	W	P	T	T	L	A	G	R	I	Y	S	Y	V	S	I	I	G	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																										?			?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		F	S	F	L	V	F	A	T	Y	L	L	I	L	F	P	L	T	F	I	V	G	S	Q	R	L	M	R	F	L	S	V	I	L	A	T	A	G	M	T	L	L	L	I	D	S	E	V	F	T	R	F	H	L	H	L	N	P	I	V	W
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		Q	L	V	I	N	P	D	E	N	E	M	A	R	D	W	Q	L	M	F	I	S	V	P	V	I	L	L	L	E	L	V	F	A	T	W	S	W	Q	K	L	R	S	L	T	R	R	R	R	F	A	R	P	L	A	A	F	L	F	I	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?	?	?	?	?	?	?																										?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		F	I	A	S	H	V	V	Y	I	W	A	D	A	N	F	Y	R	P	I	T	M	Q	R	A	N	L	P	L	S	Y	P	M	T	A	R	R	F	L	E	K	H	G	L	L	D	A	Q	E	Y	Q	R	R	L	I	E	Q	G	N	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?									?																		?			?	?										?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		A	V	S	V	Q	Y	P	L	S	E	L	R	Y	R	D	M	G	T	G	Q	N	V	L	L	I	T	V	D	G	L	N	Y	S	R	F	E	K	Q	M	P	A	L	A	G	F	A	E	Q	N	I	S	F	T	R	H	M	S	S	G	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?									?	?	?	?	?														?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		T	T	D	N	G	I	F	G	L	F	Y	G	I	S	P	S	Y	M	D	G	I	L	S	T	R	T	P	A	A	L	I	T	A	L	N	Q	Q	G	Y	Q	L	G	L	F	S	S	D	G	F	T	S	P	L	Y	R	Q	A	L	L	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder																		?	?	?	?	?		?	?		?																							?							?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		D	F	S	M	P	S	V	R	T	Q	S	D	E	Q	T	A	T	Q	W	I	N	W	L	G	R	Y	A	Q	E	D	N	R	W	F	S	W	V	S	F	N	G	T	N	I	D	D	S	N	Q	Q	A	F	A	R	K	Y	S	R	A	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder								?																			?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		G	N	V	D	D	Q	I	N	R	V	L	N	A	L	R	D	S	G	K	L	D	N	T	V	V	I	I	T	A	G	R	G	I	P	L	S	E	E	E	E	T	F	D	W	S	H	G	H	L	Q	V	P	L	V	I	H	W	P	G	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																					?	?	?	?	?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		P	A	Q	R	I	N	A	L	T	D	H	T	D	L	M	T	T	L	M	Q	R	L	L	H	V	S	T	P	A	S	E	Y	S	Q	G	Q	D	L	F	N	P	Q	R	R	H	Y	W	V	T	A	A	D	N	D	T	L	A	I	T	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder						?																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.
Sequence		P	K	K	T	L	V	L	N	N	N	G	K	Y	R	T	Y	N	L	R	G	E	R	V	K	D	E	K	P	Q	L	S	L	L	L	Q	V	L	T	D	E	K	R	F	I	A	N
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?															?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand