Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P31448 Date Thu Jan 5 11:47:39 GMT 2012 Unique Job ID 04e8c8704d89a0d2

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	S	L	Q	I	L	S	F	V	G	F	T	L	L	V	A	V	I	T	W	W	K	V	R	K	T	D	T	G	S	Q	Q	G	Y	F	L	A	G	R	S	L	K	A	P	V	I	A	A	S	L	M	L	T	N	L	S	T	E	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?																								?	?	?	?	?	?					?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		L	V	G	L	S	G	Q	A	Y	K	S	G	M	S	V	M	G	W	E	V	T	S	A	V	T	L	I	F	L	A	L	I	F	L	P	R	Y	L	K	R	G	I	A	T	I	P	D	F	L	E	E	R	Y	D	K	T	T	R	I	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	D	F	C	F	L	I	A	T	G	V	C	F	L	P	I	V	L	Y	S	G	A	L	A	L	N	S	L	F	H	V	G	E	S	L	Q	I	S	H	G	A	A	I	W	L	L	V	I	L	L	G	L	A	G	I	L	Y	A	V	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																														?	?	?		?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	G	L	R	A	M	A	V	A	D	S	I	N	G	I	G	L	V	I	G	G	L	M	V	P	V	F	G	L	I	A	M	G	K	G	S	F	M	Q	G	I	E	Q	L	T	T	V	H	A	E	K	L	N	S	I	G	G	P	T	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?		?								?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		P	L	P	I	G	A	A	F	T	G	L	I	L	V	N	T	F	Y	W	C	T	N	Q	G	I	V	Q	R	T	L	A	S	K	S	L	A	E	G	Q	K	G	A	L	L	T	A	V	L	K	M	L	D	P	L	V	L	V	L	P	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		L	I	A	F	H	L	Y	Q	D	L	P	K	A	D	M	A	Y	P	T	L	V	N	N	V	L	P	V	P	M	V	G	F	F	G	A	V	L	F	G	A	V	I	S	T	F	N	G	F	L	N	S	A	S	T	L	F	S	M	G	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		Y	R	R	I	I	N	Q	N	A	E	P	Q	Q	L	V	T	V	G	R	K	F	G	F	F	I	A	I	V	S	V	L	V	A	P	W	I	A	N	A	P	Q	G	L	Y	S	W	M	K	Q	L	N	G	I	Y	N	V	P	L	V	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	I	I	M	G	F	F	F	P	R	I	P	A	L	A	A	K	V	A	M	G	I	G	I	I	S	Y	I	T	I	N	Y	L	V	K	F	D	F	H	F	L	Y	V	L	A	C	T	F	C	I	N	V	V	V	M	L	V	I	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		I	K	P	R	A	T	P	F	T	F	K	D	A	F	A	V	D	M	K	P	W	K	N	V	K	I	A	S	I	G	I	L	F	A	M	I	G	V	Y	A	G	L	A	E	F	G	G	Y	G	T	R	W	L	A	M	I	S	Y	F	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																?			?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.
Sequence		A	A	V	V	I	V	Y	L	I	F	D	S	W	R	H	R	H	D	P	A	V	T	F	T	P	D	G	K	D	S	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																							?			?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand