Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P0ABP3 Date Thu Jan 5 11:15:59 GMT 2012 Unique Job ID 047988ec1e49e2f7

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	L	T	F	I	E	L	L	I	G	V	V	V	I	V	G	V	A	R	Y	I	I	K	G	Y	S	A	T	G	V	L	F	V	G	G	L	L	L	L	I	I	S	A	I	M	G	H	K	V	L	P	S	S	Q	A	S	T	G	Y	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?																																											?											?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		A	T	D	I	V	E	Y	V	K	I	L	L	M	S	R	G	G	D	L	G	M	M	I	M	M	L	C	G	F	A	A	Y	M	T	H	I	G	A	N	D	M	V	V	K	L	A	S	K	P	L	Q	Y	I	N	S	P	Y	L	L	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		I	A	A	Y	F	V	A	C	L	M	S	L	A	V	S	S	A	T	G	L	G	V	L	L	M	A	T	L	F	P	V	M	V	N	V	G	I	S	R	G	A	A	A	A	I	C	A	S	P	A	A	I	I	L	A	P	T	S	G	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder														?	?	?	?	?																		?															?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	V	L	A	A	Q	A	S	E	M	S	L	I	D	F	A	F	K	T	T	L	P	I	S	I	A	A	I	I	G	M	A	I	A	H	F	F	W	Q	R	Y	L	D	K	K	E	H	I	S	H	E	M	L	D	V	S	E	I	T	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder									?	?																																	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	A	P	A	F	Y	A	I	L	P	F	T	P	I	I	G	V	L	I	F	D	G	K	W	G	P	Q	L	H	I	I	T	I	L	V	I	C	M	L	I	A	S	I	L	E	F	L	R	S	F	N	T	Q	K	V	F	S	G	L	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?																			?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		V	A	Y	R	G	M	A	D	A	F	A	N	V	V	M	L	L	V	A	A	G	V	F	A	Q	G	L	S	T	I	G	F	I	Q	S	L	I	S	I	A	T	S	F	G	S	A	S	I	I	L	M	L	V	L	V	I	L	T	M	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																															?	?												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	A	V	T	T	G	S	G	N	A	P	F	Y	A	F	V	E	M	I	P	K	L	A	H	S	S	G	I	N	P	A	Y	L	T	I	P	M	L	Q	A	S	N	L	G	R	T	L	S	P	V	S	G	V	V	V	A	V	A	G	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.
Sequence		A	K	I	S	P	F	E	V	V	K	R	T	S	V	P	V	L	V	G	L	V	I	V	I	V	A	T	E	L	M	V	P	G	T	A	A	A	V	T	G	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand