Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P13009 Date Thu Jan 5 11:33:23 GMT 2012 Unique Job ID 040ac6e1ba337e6a

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	S	K	V	E	Q	L	R	A	Q	L	N	E	R	I	L	V	L	D	G	G	M	G	T	M	I	Q	S	Y	R	L	N	E	A	D	F	R	G	E	R	F	A	D	W	P	C	D	L	K	G	N	N	D	L	L	V	L	S	K
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Disorder		?	?	?	?	?																														?	?	?	?	?					?		?	?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	E	V	I	A	A	I	H	N	A	Y	F	E	A	G	A	D	I	I	E	T	N	T	F	N	S	T	T	I	A	M	A	D	Y	Q	M	E	S	L	S	A	E	I	N	F	A	A	A	K	L	A	R	A	C	A	D	E	W	T	A
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Disorder																																		?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		R	T	P	E	K	P	R	Y	V	A	G	V	L	G	P	T	N	R	T	A	S	I	S	P	D	V	N	D	P	A	F	R	N	I	T	F	D	G	L	V	A	A	Y	R	E	S	T	K	A	L	V	E	G	G	A	D	L	I	L	I
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Disorder		?	?																				?			?			?		?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		E	T	V	F	D	T	L	N	A	K	A	A	V	F	A	V	K	T	E	F	E	A	L	G	V	E	L	P	I	M	I	S	G	T	I	T	D	A	S	G	R	T	L	S	G	Q	T	T	E	A	F	Y	N	S	L	R	H	A	E	A
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		L	T	F	G	L	N	C	A	L	G	P	D	E	L	R	Q	Y	V	Q	E	L	S	R	I	A	E	C	Y	V	T	A	H	P	N	A	G	L	P	N	A	F	G	E	Y	D	L	D	A	D	T	M	A	K	Q	I	R	E	W	A	Q
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Disorder
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Sequence		A	G	F	L	N	I	V	G	G	C	C	G	T	T	P	Q	H	I	A	A	M	S	R	A	V	E	G	L	A	P	R	K	L	P	E	I	P	V	A	C	R	L	S	G	L	E	P	L	N	I	G	E	D	S	L	F	V	N	V	G
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		E	R	T	N	V	T	G	S	A	K	F	K	R	L	I	K	E	E	K	Y	S	E	A	L	D	V	A	R	Q	Q	V	E	N	G	A	Q	I	I	D	I	N	M	D	E	G	M	L	D	A	E	A	A	M	V	R	F	L	N	L	I
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		A	G	E	P	D	I	A	R	V	P	I	M	I	D	S	S	K	W	D	V	I	E	K	G	L	K	C	I	Q	G	K	G	I	V	N	S	I	S	M	K	E	G	V	D	A	F	I	H	H	A	K	L	L	R	R	Y	G	A	A	V
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		V	V	M	A	F	D	E	Q	G	Q	A	D	T	R	A	R	K	I	E	I	C	R	R	A	Y	K	I	L	T	E	E	V	G	F	P	P	E	D	I	I	F	D	P	N	I	F	A	V	A	T	G	I	E	E	H	N	N	Y	A	Q
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		D	F	I	G	A	C	E	D	I	K	R	E	L	P	H	A	L	I	S	G	G	V	S	N	V	S	F	S	F	R	G	N	D	P	V	R	E	A	I	H	A	V	F	L	Y	Y	A	I	R	N	G	M	D	M	G	I	V	N	A	G
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Disorder																		?													?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		Q	L	A	I	Y	D	D	L	P	A	E	L	R	D	A	V	E	D	V	I	L	N	R	R	D	D	G	T	E	R	L	L	E	L	A	E	K	Y	R	G	S	K	T	D	D	T	A	N	A	Q	Q	A	E	W	R	S	W	E	V	N
Secondary structure
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Disorder																											?													?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	670	.	.	.	.	.	.	.	.	.	680	.	.	.	.	.	.	.	.	.	690	.	.	.	.	.	.	.	.	.	700	.	.	.	.	.	.	.	.	.	710	.	.	.	.	.	.	.	.	.	720
Sequence		K	R	L	E	Y	S	L	V	K	G	I	T	E	F	I	E	Q	D	T	E	E	A	R	Q	Q	A	T	R	P	I	E	V	I	E	G	P	L	M	D	G	M	N	V	V	G	D	L	F	G	E	G	K	M	F	L	P	Q	V	V	K
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Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	730	.	.	.	.	.	.	.	.	.	740	.	.	.	.	.	.	.	.	.	750	.	.	.	.	.	.	.	.	.	760	.	.	.	.	.	.	.	.	.	770	.	.	.	.	.	.	.	.	.	780
Sequence		S	A	R	V	M	K	Q	A	V	A	Y	L	E	P	F	I	E	A	S	K	E	Q	G	K	T	N	G	K	M	V	I	A	T	V	K	G	D	V	H	D	I	G	K	N	I	V	G	V	V	L	Q	C	N	N	Y	E	I	V	D	L
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SS confidence
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	790	.	.	.	.	.	.	.	.	.	800	.	.	.	.	.	.	.	.	.	810	.	.	.	.	.	.	.	.	.	820	.	.	.	.	.	.	.	.	.	830	.	.	.	.	.	.	.	.	.	840
Sequence		G	V	M	V	P	A	E	K	I	L	R	T	A	K	E	V	N	A	D	L	I	G	L	S	G	L	I	T	P	S	L	D	E	M	V	N	V	A	K	E	M	E	R	Q	G	F	T	I	P	L	L	I	G	G	A	T	T	S	K	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	850	.	.	.	.	.	.	.	.	.	860	.	.	.	.	.	.	.	.	.	870	.	.	.	.	.	.	.	.	.	880	.	.	.	.	.	.	.	.	.	890	.	.	.	.	.	.	.	.	.	900
Sequence		H	T	A	V	K	I	E	Q	N	Y	S	G	P	T	V	Y	V	Q	N	A	S	R	T	V	G	V	V	A	A	L	L	S	D	T	Q	R	D	D	F	V	A	R	T	R	K	E	Y	E	T	V	R	I	Q	H	G	R	K	K	P	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																				?																			?	?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	910	.	.	.	.	.	.	.	.	.	920	.	.	.	.	.	.	.	.	.	930	.	.	.	.	.	.	.	.	.	940	.	.	.	.	.	.	.	.	.	950	.	.	.	.	.	.	.	.	.	960
Sequence		T	P	P	V	T	L	E	A	A	R	D	N	D	F	A	F	D	W	Q	A	Y	T	P	P	V	A	H	R	L	G	V	Q	E	V	E	A	S	I	E	T	L	R	N	Y	I	D	W	T	P	F	F	M	T	W	S	L	A	G	K	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?				?																																						?	?	?	?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	970	.	.	.	.	.	.	.	.	.	980	.	.	.	.	.	.	.	.	.	990	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1000	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1010	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1020
Sequence		P	R	I	L	E	D	E	V	V	G	V	E	A	Q	R	L	F	K	D	A	N	D	M	L	D	K	L	S	A	E	K	T	L	N	P	R	G	V	V	G	L	F	P	A	N	R	V	G	D	D	I	E	I	Y	R	D	E	T	R	T
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SS confidence
Disorder		?	?			?
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Sequence		H	V	I	N	V	S	H	H	L	R	Q	Q	T	E	K	T	G	F	A	N	Y	C	L	A	D	F	V	A	P	K	L	S	G	K	A	D	Y	I	G	A	F	A	V	T	G	G	L	E	E	D	A	L	A	D	A	F	E	A	Q	H
Secondary structure
SS confidence
Disorder											?	?	?	?	?	?	?	?	?											?																													?	?	?
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		.	.	.	.	.	.	.	.	.	1090	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1120	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	1140
Sequence		D	D	Y	N	K	I	M	V	K	A	L	A	D	R	L	A	E	A	F	A	E	Y	L	H	E	R	V	R	K	V	Y	W	G	Y	A	P	N	E	N	L	S	N	E	E	L	I	R	E	N	Y	Q	G	I	R	P	A	P	G	Y	P
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Disorder		?																														?						?	?	?	?							?	?	?		?
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Sequence		A	C	P	E	H	T	E	K	A	T	I	W	E	L	L	E	V	E	K	H	T	G	M	K	L	T	E	S	F	A	M	W	P	G	A	S	V	S	G	W	Y	F	S	H	P	D	S	K	Y	Y	A	V	A	Q	I	Q	R	D	Q	V
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Disorder																				?																																				?
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Sequence		E	D	Y	A	R	R	K	G	M	S	V	T	E	V	E	R	W	L	A	P	N	L	G	Y	D	A	D
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SS confidence
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