Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P37013 Date Thu Jan 5 11:54:23 GMT 2012 Unique Job ID 03f8a9eefd7b2cf8

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	S	F	S	V	D	V	L	A	N	I	A	I	E	L	Q	R	G	I	G	H	Q	D	R	F	Q	R	L	I	T	T	L	R	Q	V	L	E	C	D	A	S	A	L	L	R	Y	D	S	R	Q	F	I	P	L	A	I	D	G	L	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?												?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		K	D	V	L	G	R	R	F	A	L	E	G	H	P	R	L	E	A	I	A	R	A	G	D	V	V	R	F	P	A	D	S	E	L	P	D	P	Y	D	G	L	I	P	G	Q	E	S	L	K	V	H	A	C	V	G	L	P	L	F	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?	?	?	?	?	?			?	?																						?		?												?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		G	Q	N	L	I	G	A	L	T	L	D	G	M	Q	P	D	Q	F	D	V	F	S	D	E	E	L	R	L	I	A	A	L	A	A	G	A	L	S	N	A	L	L	I	E	Q	L	E	S	Q	N	M	L	P	G	D	A	T	P	F	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																									?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		A	V	K	Q	T	Q	M	I	G	L	S	P	G	M	T	Q	L	K	K	E	I	E	I	V	A	A	S	D	L	N	V	L	I	S	G	E	T	G	T	G	K	E	L	V	A	K	A	I	H	E	A	S	P	R	A	V	N	P	L	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																																								?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		Y	L	N	C	A	A	L	P	E	S	V	A	E	S	E	L	F	G	H	V	K	G	A	F	T	G	A	I	S	N	R	S	G	K	F	E	M	A	D	N	G	T	L	F	L	D	E	I	G	E	L	S	L	A	L	Q	A	K	L	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																													?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	V	L	Q	Y	G	D	I	Q	R	V	G	D	D	R	C	L	R	V	D	V	R	V	L	A	A	T	N	R	D	L	R	E	E	V	L	A	G	R	F	R	A	D	L	F	H	R	L	S	V	F	P	L	S	V	P	P	L	R	E
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?																										?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		R	G	D	D	V	I	L	L	A	G	Y	F	C	E	Q	C	R	L	R	Q	G	L	S	R	V	V	L	S	A	G	A	R	N	L	L	Q	H	Y	S	F	P	G	N	V	R	E	L	E	H	A	I	H	R	A	V	V	L	A	R	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder																								?	?		?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		T	R	S	G	D	E	V	I	L	E	A	Q	H	F	A	F	P	E	V	T	L	P	T	P	E	V	A	A	V	P	V	V	K	Q	N	L	R	E	A	T	E	A	F	Q	R	E	T	I	R	Q	A	L	A	Q	N	H	H	N	W	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?																						?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.
Sequence		A	C	A	R	M	L	E	T	D	V	A	N	L	H	R	L	A	K	R	L	G	L	K	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder																					?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand