Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P76161 Date Thu Jan 5 12:19:56 GMT 2012 Unique Job ID 03908fb7538dd54f

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	L	E	A	L	P	K	Y	Y	S	P	K	S	P	K	L	S	D	D	A	P	A	T	G	T	G	C	L	T	I	T	D	V	M	A	A	Q	G	M	V	Q	S	K	A	P	L	G	L	A	L	F	L	A	K	V	G	V	Q	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?															?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?												?	?	?	?	?									?		?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	Q	F	A	I	E	G	L	L	N	Y	A	M	A	L	D	N	P	T	L	N	K	L	S	E	E	I	R	L	Q	I	I	P	Y	L	V	S	F	A	F	A	D	Y	S	R	S	A	A	S	K	A	R	C	E	H	C	S	G	T	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder															?	?	?	?	?	?	?			?	?			?	?																	?	?						?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		F	Y	N	V	L	R	E	V	V	K	H	Y	R	R	G	E	S	V	I	K	E	E	W	V	K	E	L	C	Q	H	C	H	G	K	G	E	A	S	T	A	C	R	G	C	K	G	K	G	I	V	L	D	E	K	R	T	R	F	H	G
Secondary structure
SS confidence
Disorder												?			?	?	?	?		?	?	?	?	?	?							?	?	?	?					?		?	?	?	?	?	?							?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		V	P	V	Y	K	I	C	G	R	C	N	G	N	R	F	S	R	L	P	T	T	L	A	R	R	H	V	Q	K	L	V	P	D	L	T	D	Y	Q	W	Y	K	G	Y	A	D	V	I	G	K	L	V	T	K	C	W	Q	E	E	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?									?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250
Sequence		A	E	A	Q	L	R	K	V	T	R
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand