Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P77398 Date Thu Jan 5 12:28:36 GMT 2012 Unique Job ID 02c11fb33aedbb0d

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	K	T	V	V	F	A	Y	H	D	M	G	C	L	G	I	E	A	L	L	A	A	G	Y	E	I	S	A	I	F	T	H	T	D	N	P	G	E	K	A	F	Y	G	S	V	A	R	L	A	A	E	R	G	I	P	V	Y	A	P	D
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																																				?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		N	V	N	H	P	L	W	V	E	R	I	A	Q	L	S	P	D	V	I	F	S	F	Y	Y	R	H	L	I	Y	D	E	I	L	Q	L	A	P	A	G	A	F	N	L	H	G	S	L	L	P	K	Y	R	G	R	A	P	L	N	W	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		L	V	N	G	E	T	E	T	G	V	T	L	H	R	M	V	K	R	A	D	A	G	A	I	V	A	Q	L	R	I	A	I	A	P	D	D	I	A	I	T	L	H	H	K	L	C	H	A	A	R	Q	L	L	E	Q	T	L	P	A	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		K	H	G	N	I	L	E	I	A	Q	R	E	N	E	A	T	C	F	G	R	R	T	P	D	D	S	F	L	E	W	H	K	P	A	S	V	L	H	N	M	V	R	A	V	A	D	P	W	P	G	A	F	S	Y	V	G	N	Q	K	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?					?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		T	V	W	S	S	R	V	H	P	H	A	S	K	A	Q	P	G	S	V	I	S	V	A	P	L	L	I	A	C	G	D	G	A	L	E	I	V	T	G	Q	A	G	D	G	I	T	M	Q	G	S	Q	L	A	Q	T	L	G	L	V	Q
Secondary structure
SS confidence
Disorder										?	?	?	?	?			?																												?														?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		G	S	R	L	N	S	Q	P	A	C	T	A	R	R	R	T	R	V	L	I	L	G	V	N	G	F	I	G	N	H	L	T	E	R	L	L	R	E	D	H	Y	E	V	Y	G	L	D	I	G	S	D	A	I	S	R	F	L	N	H	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		H	F	H	F	V	E	G	D	I	S	I	H	S	E	W	I	E	Y	H	V	K	K	C	D	V	V	L	P	L	V	A	I	A	T	P	I	E	Y	T	R	N	P	L	R	V	F	E	L	D	F	E	E	N	L	R	I	I	R	Y	C
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		V	K	Y	R	K	R	I	I	F	P	S	T	S	E	V	Y	G	M	C	S	D	K	Y	F	D	E	D	H	S	N	L	I	V	G	P	V	N	K	P	R	W	I	Y	S	V	S	K	Q	L	L	D	R	V	I	W	A	Y	G	E	K
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		E	G	L	Q	F	T	L	F	R	P	F	N	W	M	G	P	R	L	D	N	L	N	A	A	R	I	G	S	S	R	A	I	T	Q	L	I	L	N	L	V	E	G	S	P	I	K	L	I	D	G	G	K	Q	K	R	C	F	T	D	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder																						?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.	.	.	.	.	.	.	.	.	560	.	.	.	.	.	.	.	.	.	570	.	.	.	.	.	.	.	.	.	580	.	.	.	.	.	.	.	.	.	590	.	.	.	.	.	.	.	.	.	600
Sequence		R	D	G	I	E	A	L	Y	R	I	I	E	N	A	G	N	R	C	D	G	E	I	I	N	I	G	N	P	E	N	E	A	S	I	E	E	L	G	E	M	L	L	A	S	F	E	K	H	P	L	R	H	H	F	P	P	F	A	G	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																																		?	?	?	?					?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	610	.	.	.	.	.	.	.	.	.	620	.	.	.	.	.	.	.	.	.	630	.	.	.	.	.	.	.	.	.	640	.	.	.	.	.	.	.	.	.	650	.	.	.	.	.	.	.	.	.	660
Sequence		R	V	V	E	S	S	S	Y	Y	G	K	G	Y	Q	D	V	E	H	R	K	P	S	I	R	N	A	H	R	C	L	D	W	E	P	K	I	D	M	Q	E	T	I	D	E	T	L	D	F	F	L	R	T	V	D	L	T	D	K	P	S
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?				?	?	?	?	?	?																																										?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
Sequence
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand