Email l.a.kelley@imperial.ac.uk Description P33231 Date Thu Jan 5 11:51:31 GMT 2012 Unique Job ID 0271cbe961755b89

Secondary structure and disorder prediction

		1	.	.	.	.	.	.	.	.	10	.	.	.	.	.	.	.	.	.	20	.	.	.	.	.	.	.	.	.	30	.	.	.	.	.	.	.	.	.	40	.	.	.	.	.	.	.	.	.	50	.	.	.	.	.	.	.	.	.	60
Sequence		M	N	L	W	Q	Q	N	Y	D	P	A	G	N	I	W	L	S	S	L	I	A	S	L	P	I	L	F	F	F	F	A	L	I	K	L	K	L	K	G	Y	V	A	A	S	W	T	V	A	I	A	L	A	V	A	L	L	F	Y	K	M
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?	?	?	?	?	?	?																												?	?		?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	70	.	.	.	.	.	.	.	.	.	80	.	.	.	.	.	.	.	.	.	90	.	.	.	.	.	.	.	.	.	100	.	.	.	.	.	.	.	.	.	110	.	.	.	.	.	.	.	.	.	120
Sequence		P	V	A	N	A	L	A	S	V	V	Y	G	F	F	Y	G	L	W	P	I	A	W	I	I	I	A	A	V	F	V	Y	K	I	S	V	K	T	G	Q	F	D	I	I	R	S	S	I	L	S	I	T	P	D	Q	R	L	Q	M	L	I
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	130	.	.	.	.	.	.	.	.	.	140	.	.	.	.	.	.	.	.	.	150	.	.	.	.	.	.	.	.	.	160	.	.	.	.	.	.	.	.	.	170	.	.	.	.	.	.	.	.	.	180
Sequence		V	G	F	C	F	G	A	F	L	E	G	A	A	G	F	G	A	P	V	A	I	T	A	A	L	L	V	G	L	G	F	K	P	L	Y	A	A	G	L	C	L	I	V	N	T	A	P	V	A	F	G	A	M	G	I	P	I	L	V	A
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	190	.	.	.	.	.	.	.	.	.	200	.	.	.	.	.	.	.	.	.	210	.	.	.	.	.	.	.	.	.	220	.	.	.	.	.	.	.	.	.	230	.	.	.	.	.	.	.	.	.	240
Sequence		G	Q	V	T	G	I	D	S	F	E	I	G	Q	M	V	G	R	Q	L	P	F	M	T	I	I	V	L	F	W	I	M	A	I	M	D	G	W	R	G	I	K	E	T	W	P	A	V	V	V	A	G	G	S	F	A	I	A	Q	Y	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder			?		?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	250	.	.	.	.	.	.	.	.	.	260	.	.	.	.	.	.	.	.	.	270	.	.	.	.	.	.	.	.	.	280	.	.	.	.	.	.	.	.	.	290	.	.	.	.	.	.	.	.	.	300
Sequence		S	S	N	F	I	G	P	E	L	P	D	I	I	S	S	L	V	S	L	L	C	L	T	L	F	L	K	R	W	Q	P	V	R	V	F	R	F	G	D	L	G	A	S	Q	V	D	M	T	L	A	H	T	G	Y	T	A	G	Q	V	L
Secondary structure
SS confidence
Disorder																																			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	310	.	.	.	.	.	.	.	.	.	320	.	.	.	.	.	.	.	.	.	330	.	.	.	.	.	.	.	.	.	340	.	.	.	.	.	.	.	.	.	350	.	.	.	.	.	.	.	.	.	360
Sequence		R	A	W	T	P	F	L	F	L	T	A	T	V	T	L	W	S	I	P	P	F	K	A	L	F	A	S	G	G	A	L	Y	E	W	V	I	N	I	P	V	P	Y	L	D	K	L	V	A	R	M	P	P	V	V	S	E	A	T	A	Y
Secondary structure
SS confidence
Disorder																			?		?	?	?	?	?	?	?	?	?		?	?	?									?				?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?	?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	370	.	.	.	.	.	.	.	.	.	380	.	.	.	.	.	.	.	.	.	390	.	.	.	.	.	.	.	.	.	400	.	.	.	.	.	.	.	.	.	410	.	.	.	.	.	.	.	.	.	420
Sequence		A	A	V	F	K	F	D	W	F	S	A	T	G	T	A	I	L	F	A	A	L	L	S	I	V	W	L	K	M	K	P	S	D	A	I	S	T	F	G	S	T	L	K	E	L	A	L	P	I	Y	S	I	G	M	V	L	A	F	A	F
Secondary structure
SS confidence
Disorder		?																												?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	430	.	.	.	.	.	.	.	.	.	440	.	.	.	.	.	.	.	.	.	450	.	.	.	.	.	.	.	.	.	460	.	.	.	.	.	.	.	.	.	470	.	.	.	.	.	.	.	.	.	480
Sequence		I	S	N	Y	S	G	L	S	S	T	L	A	L	A	L	A	H	T	G	H	A	F	T	F	F	S	P	F	L	G	W	L	G	V	F	L	T	G	S	D	T	S	S	N	A	L	F	A	A	L	Q	A	T	A	A	Q	Q	I	G	V
Secondary structure
SS confidence
Disorder				?			?																																																				?
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	490	.	.	.	.	.	.	.	.	.	500	.	.	.	.	.	.	.	.	.	510	.	.	.	.	.	.	.	.	.	520	.	.	.	.	.	.	.	.	.	530	.	.	.	.	.	.	.	.	.	540
Sequence		S	D	L	L	L	V	A	A	N	T	T	G	G	V	T	G	K	M	I	S	P	Q	S	I	A	I	A	C	A	A	V	G	L	V	G	K	E	S	D	L	F	R	F	T	V	K	H	S	L	I	F	T	C	I	V	G	V	I	T	T
Secondary structure
SS confidence
Disorder
Disorder confidence
		.	.	.	.	.	.	.	.	.	550	.
Sequence		L	Q	A	Y	V	L	T	W	M	I	P
Secondary structure
SS confidence
Disorder							?	?	?	?	?	?
Disorder confidence

Confidence Key
High(9)											Low (0)

?	Disordered
	Alpha helix
	Beta strand